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关于VASP的并行
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关于VASP的并行
最近用vasp的时候发现一个问题,vasp编译正确。进行200对个原子的计算时,采用单个节点(包含12和核),可以很快的开始计算。但是采用2个节点以上的资源时,就会在读取波函数的位置卡很撑时间,
OUTCAR中一直停在:
Maximum index for non-local projection operator
Maximum index for augmentation-charges (set IRDMAX)
大家还有遇到过这个问题的吗?对于这个问题我尝试了很多方法,都不能解决啊,有时候,多节点会卡大约24小时!
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2014-11-24 19:58:32
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8楼
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Originally posted by
vasp_wien2k
at 2014-11-29 16:04:01
单节点有几个cpu啊?
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9楼
2014-11-30 08:32:29
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2014-11-26 19:30:15
个人觉得vasp并行计算的快慢与原子个数有很大关系。原子数目不大的体系,并得越多反而越慢。比如一个体系只有几个原子。不并行很快就算完了,并行反而变慢。对于几百个原子的大体系,并行应该会快些。还有vasp可以自动识别物理核,即不需要并行直接输入vasp命令,也可以达到并行效果。
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2014-11-26 14:54:30
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2014-11-30 17:13:11
这个不是软件的问题,是因为两个节点直接通信速度没法达到那么快,尤其是你体系大的时候,需要通信的信息也许千兆路由器都受不了(有时候千兆网还不是你独享),而单个节点内部通信自然很快,只要内存够大就没问题。
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凝聚态理论与计算物理
3楼
2014-11-26 15:53:10
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所以建议还是单个节点计算,最好不要跨节点计算。
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凝聚态理论与计算物理
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2014-11-26 15:56:22
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