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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于VASP的并行
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钢金术师

金虫 (小有名气)

[交流] 关于VASP的并行

最近用vasp的时候发现一个问题，vasp编译正确。进行200对个原子的计算时，采用单个节点（包含12和核），可以很快的开始计算。但是采用2个节点以上的资源时，就会在读取波函数的位置卡很撑时间，
OUTCAR中一直停在：
                                 Maximum index for non-local projection operator         
                                 Maximum index for augmentation-charges          (set IRDMAX)

大家还有遇到过这个问题的吗？对于这个问题我尝试了很多方法，都不能解决啊，有时候，多节点会卡大约24小时！
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1楼 2014-11-24 19:58:32
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wmy8802217

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-11-30 17:13:11
这个不是软件的问题，是因为两个节点直接通信速度没法达到那么快，尤其是你体系大的时候，需要通信的信息也许千兆路由器都受不了（有时候千兆网还不是你独享），而单个节点内部通信自然很快，只要内存够大就没问题。
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凝聚态理论与计算物理
3楼2014-11-26 15:53:10
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200909140505

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ljw4010: 金币+1, 谢谢交流！ 2014-11-26 19:30:15
个人觉得vasp并行计算的快慢与原子个数有很大关系。原子数目不大的体系，并得越多反而越慢。比如一个体系只有几个原子。不并行很快就算完了，并行反而变慢。对于几百个原子的大体系，并行应该会快些。还有vasp可以自动识别物理核，即不需要并行直接输入vasp命令，也可以达到并行效果。
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2楼2014-11-26 14:54:30
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wmy8802217

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
所以建议还是单个节点计算，最好不要跨节点计算。
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凝聚态理论与计算物理
4楼2014-11-26 15:56:22
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wmy8802217

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ljw4010: 金币+1, 谢谢交流！ 2014-11-26 19:30:27
钢金术师: 金币+10 2014-11-27 08:54:42
单个节点内部中，内存的读写速度可以达到GB/s量级，而千兆网最大才125MB/S，跨界点计算的话大部分时间都耗在通信上了
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凝聚态理论与计算物理
5楼2014-11-26 16:01:09
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