24小时热门版块排行榜    

查看: 2234  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shully

新虫 (小有名气)

[求助] DGGE切胶回收后测序,结果全是双峰?! 已有3人参与

送出去测序,73个样品,只有4个是已通,其余的全是双峰。请问这是怎么回事呢?
切胶后回收的PCR程序没有用之前的那个,是一个简单得多的,是因为这个原因吗?
还是我切胶的技术太差,全割成几个条带一块儿的了?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

boyoushun

新虫 (初入文坛)


是不是直接测序啊
6楼2014-11-22 09:30:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员

感谢参与,应助指数 +1
youlinglyw: 应助指数-1, 非应助 2014-11-22 12:13:54
你是TA克隆后做的测序吗?
专注微生物多样性分析QQ2758452825
2楼2014-11-14 15:03:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shully

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 微基生物 at 2014-11-14 15:03:19
你是TA克隆后做的测序吗?

不是,我们这边没条件,是PCR后送到外边去测序,好像说如果结果不好再TA克隆吧
3楼2014-11-14 16:10:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

myrazhang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

看你的样品是不是微生物量很丰富,如果微生物量较大,相似微生物群落较多的话,可能是你的DGGE并没彻底分开不同菌株,所以建议优化变性剂的梯度~或者切胶回收的DNA样品,再用相同带GC夹子的引物PCR,扩增产物再做DGGE,这样既能检测是否单条带,又能再次分离杂条带。
但是,据 Yang 和 Crowley ( 2004 )的研究发现有时同一 DGGE 条带可能含有两种或两种以上的微生物。所以~DGGE能反映多样性和丰富度,但是作为菌群检测,还是应该选择更先进的方法了哈~
4楼2014-11-17 17:04:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +19 羊腰板 2026-08-21 22/1100 2026-08-25 10:38 by popular289
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 明天应该可查了!? +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
信息提示
请填处理意见