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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)

[求助] 求教sybyl批量处理小分子的一些问题, 已有1人参与

我现在有4000个分子的mol2文件,请问如何导入到sybyl一个数据库中,并批量计算这些1.分子形式电荷(筛选0~2),2.脂水分配系数(筛选-2~5),3.以及有无反应基团,多谢大家!
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修罗
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912941425

木虫 (正式写手)

你可以新建一个表单,在菜单栏import你的数据库,里面有很多选项,电荷,疏水性......很久没用,印象中可以做的
梦想很难,但值得我一生追求
2楼2014-11-14 11:06:49
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 912941425 at 2014-11-14 11:06:49
你可以新建一个表单,在菜单栏import你的数据库,里面有很多选项,电荷,疏水性......很久没用,印象中可以做的

求详细步骤。。。
修罗
3楼2014-11-14 11:20:49
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 912941425 at 2014-11-14 11:06:49
你可以新建一个表单,在菜单栏import你的数据库,里面有很多选项,电荷,疏水性......很久没用,印象中可以做的

求详细步骤。。。
修罗
4楼2014-11-14 11:31:26
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 912941425 at 2014-11-14 11:06:49
你可以新建一个表单,在菜单栏import你的数据库,里面有很多选项,电荷,疏水性......很久没用,印象中可以做的

怎么新建表单呢?我试着把4000个分子同时打开但是提示超出限制之类的提示
修罗
5楼2014-11-14 11:41:50
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匿名

用户注销 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
atmdd: 金币+10, 有帮助, 没解决呢,请见下面回复 2014-11-19 17:04:02
本帖仅楼主可见
6楼2014-11-18 15:44:52
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 宝马bm at 2014-11-18 15:44:52
你的4000个分子是在一个mol2文件还是400个mol2文件?
如果是4000个单独mol2文件,import->选中分子->OK。
export->全选,看好保存在哪儿,默认在主文件夹下,这里也可以选择保存成什么格式->OK
Appl ...

4000个mol2文件,import->选中分子->选中4000个分子后提示unable to add file ,the buffer used to hold the list of files has reached ites maximum please unselect files and/or precess the ones already chosen.这个怎么处理?如何新建表单呢?
修罗
7楼2014-11-18 18:00:51
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