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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 求教sybyl批量处理小分子的一些问题，
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)

[求助] 求教sybyl批量处理小分子的一些问题， 已有1人参与

我现在有4000个分子的mol2文件，请问如何导入到sybyl一个数据库中，并批量计算这些1.分子形式电荷（筛选0~2），2.脂水分配系数（筛选-2~5），3.以及有无反应基团，多谢大家！
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修罗
1楼 2014-11-14 10:55:03
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912941425

木虫 (正式写手)
你可以新建一个表单，在菜单栏import你的数据库，里面有很多选项，电荷，疏水性......很久没用，印象中可以做的
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梦想很难，但值得我一生追求
2楼2014-11-14 11:06:49
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 912941425 at 2014-11-14 11:06:49
你可以新建一个表单，在菜单栏import你的数据库，里面有很多选项，电荷，疏水性......很久没用，印象中可以做的

求详细步骤。。。
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修罗
3楼2014-11-14 11:20:49
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)
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2楼: Originally posted by 912941425 at 2014-11-14 11:06:49
你可以新建一个表单，在菜单栏import你的数据库，里面有很多选项，电荷，疏水性......很久没用，印象中可以做的

求详细步骤。。。
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修罗
4楼2014-11-14 11:31:26
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atmdd

捐助贵宾 (著名写手)
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2楼: Originally posted by 912941425 at 2014-11-14 11:06:49
你可以新建一个表单，在菜单栏import你的数据库，里面有很多选项，电荷，疏水性......很久没用，印象中可以做的

怎么新建表单呢？我试着把4000个分子同时打开但是提示超出限制之类的提示
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修罗
5楼2014-11-14 11:41:50
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匿名

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atmdd: 金币+10, ★有帮助, 没解决呢，请见下面回复 2014-11-19 17:04:02
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6楼2014-11-18 15:44:52
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atmdd

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6楼: Originally posted by 宝马bm at 2014-11-18 15:44:52
你的4000个分子是在一个mol2文件还是400个mol2文件？
如果是4000个单独mol2文件，import->选中分子->OK。
export->全选，看好保存在哪儿，默认在主文件夹下，这里也可以选择保存成什么格式->OK
Appl ...

4000个mol2文件，import->选中分子->选中4000个分子后提示unable to add file ,the buffer used to hold the list of files has reached ites maximum please unselect files and/or precess the ones already chosen.这个怎么处理？如何新建表单呢？
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修罗
7楼2014-11-18 18:00:51
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