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yangzerui

新虫 (初入文坛)

[求助] 求高手分析dgge图谱 已有3人参与

为什么琼脂糖电泳目的条带很亮，但还是很少条带啊

求高手分析dgge图谱
Owner 2014-11-09 11 小时 28 分钟.jpg
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1楼 2014-11-09 16:52:29
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lance-tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by yangzerui at 2014-11-18 21:55:15
小鼠肠道细菌啊，就是想分析肠道菌群的多样性，但是现在条带很少，不好分析啊...

建议楼主把梯度再加大点儿。感觉下面的条带都要触到胶底了。上半部分其实还是有比较密集的条带没分开。
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新手入门求各位大神指导
11楼2014-11-26 10:22:09
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微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-11-10 16:21:55
1、你跑的变性浓度是多大？
2、你做的是什么样本中的微生物？做的常规的建库还是做的功能基因？
3、感觉你胶的上半截还是有带的，只是没有跑开。
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专注微生物多样性分析QQ2758452825
2楼2014-11-10 09:30:27
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yangzerui

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 微基生物 at 2014-11-10 09:30:27
1、你跑的变性浓度是多大？
2、你做的是什么样本中的微生物？做的常规的建库还是做的功能基因？
3、感觉你胶的上半截还是有带的，只是没有跑开。

8％变性胶，然后梯度是40%-60%,想建立肠道菌群的指纹图谱，然后是用粪便样本，就是上面很多东西不知怎样弄好
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3楼2014-11-10 22:56:39
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lance-tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
yangzerui(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-11-16 22:21:44
你的上样量是多少？如果上样量少的话有时候条带也会很少。
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4楼2014-11-12 20:45:09
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yangzerui

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lance-tan at 2014-11-12 20:45:09
你的上样量是多少？如果上样量少的话有时候条带也会很少。

上样量25ul，凝胶电泳上样3ul已经很亮了
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5楼2014-11-16 21:22:53
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lance-tan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

是什么环境样品？土样 水样还是其他的？ 做的什么微生物？
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6楼2014-11-17 12:32:10
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yangzerui

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lance-tan at 2014-11-17 12:32:10
是什么环境样品？土样 水样还是其他的？ 做的什么微生物？

小鼠肠道细菌啊，就是想分析肠道菌群的多样性，但是现在条带很少，不好分析啊
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7楼2014-11-18 21:55:15
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在雨中

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-20 13:01:12
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-26 11:35:30
可以用20个泳道的梳子，梯度放大一点，条带挺多的。细菌应该最容易了呀

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8楼2014-11-19 09:42:52
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yangzerui

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 在雨中 at 2014-11-19 09:42:52
可以用20个泳道的梳子，梯度放大一点，条带挺多的。细菌应该最容易了呀

是啊 每次pcr之后琼脂糖凝胶电泳都有很亮的条带，但是就是做dgge很少条带出来，现在把模板加大了还是条带很少，是因为梯度的问题吗？
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9楼2014-11-19 12:53:16
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在雨中

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-26 11:35:35
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9楼: Originally posted by yangzerui at 2014-11-19 12:53:16
是啊 每次pcr之后琼脂糖凝胶电泳都有很亮的条带，但是就是做dgge很少条带出来，现在把模板加大了还是条带很少，是因为梯度的问题吗？...

也许是胶没配好，也许是水平问题

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10楼2014-11-20 13:48:42
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