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石花菜spp

新虫 (初入文坛)

[求助] 表达谱差异表达基因分析

求助,之前有做过4个处理两个生物学重复的表达谱,在分析差异表达基因是用到的是DEseq,但是最近又测了一批数据,是5个处理,两个生物学重复的,做基因差异表达分析时,有推荐用卡方(2*2),不知道DEseq和卡方(2*2)哪种方法更合适呢?他们有什么优劣呢?
急求!!谢谢
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