24小时热门版块排行榜    

查看: 4861  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

jidanaoyun

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps中LJ势能下单位问题 已有1人参与

求助一个问题,抱着一点小希望能有前辈给予指点。金币不多,海涵。。。

在lammps中,系统中有两种原子A和B,原子间势能都是L-J势,系统单位为units lj

由于在lj单位制下,物理量都是无量纲的,其中 长度单位就是LJ势中的参数 sigma
此时比如我定义了盒子大小为[0 0 0 ]-[1 1 1],那盒子的边长是 1*sigma A 还是 sigma B 呢 ?

还是说,我只能用real的单位制?

读便手册也没找到答案 哎。。。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangluwei

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jidanaoyun at 2014-10-31 10:28:10
感谢前辈赐教,我不知道怎么设置A为1,是不是如下命令就能将sigmaA设为1呢?

pair_coeff        1 1 1.0 1.0 2.5
pair_coeff        2 2 1.4564 0.0252 2.5
pair_modify mix arithmetic

如果我的第一行改为:pair_coeff ...

请问用lj势可以不涉及集体的原子么?如ar,H,C等。不涉及两种的具体原子该怎么写?我不知道怎么写,就用了具体的晶格常数,我这样写的对么?
# LJ 12-6 system with npt ensemble
units lj
atom_style atomic
boundary                p p p

lattice  fcc 1.073
lattice  fcc  0.8
region box block 0 10 0 5 0 5
create_box 2 box

create_atoms 1 box

create_atoms 2 box

mass 1 1.0
mass 2 1.0

velocity                 all create 0.01 872877
timestep                0.01
dump                     1 all xyz 1000   lj.xyz

pair_style lj/cut 2.5
pair_coeff  1 1 1.0 1.0 2.5
pair_coeff  2 2 1.6 1.1765 2.5
pair_coeff  1 2 0.2 1.0882 2.5

#pair_modify shift yes mix geometric

neighbor 0.3 bin
neigh_modify every 10 delay 0 check yes
thermo                  1000

fix                   1 all npt temp 0.01 0.01 1.00 iso 0.0024 0.0024 100.0  
run                   50000
unfix                   1
thermo                  1000
运行结果总出现nan怎么回事?我想不用到集体的原子怎么写?谢谢
6楼2017-04-15 21:27:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

ktwyw

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jidanaoyun: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-10-31 10:23:28
A和B是由你决定的,你愿意让哪个做单位都行,关键是单位选定之后,做单位的那个就是1,另外一个相应改变。比如sigma_A=2sigma_B,如果A作单位,B就是0.5;如果B作单位,A就是2。另外设置的时候注意各自的截断半径以及A与B发生作用时的mixing rule。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好学习,天天向上。
2楼2014-10-30 18:41:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jidanaoyun

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ktwyw at 2014-10-30 18:41:34
A和B是由你决定的,你愿意让哪个做单位都行,关键是单位选定之后,做单位的那个就是1,另外一个相应改变。比如sigma_A=2sigma_B,如果A作单位,B就是0.5;如果B作单位,A就是2。另外设置的时候注意各自的截断半径以 ...

感谢前辈赐教,我不知道怎么设置A为1,是不是如下命令就能将sigmaA设为1呢?

pair_coeff        1 1 1.0 1.0 2.5
pair_coeff        2 2 1.4564 0.0252 2.5
pair_modify mix arithmetic

如果我的第一行改为:pair_coeff        1 1 2.0 2.0 2.5,其他参数不变,那盒子边长又应该是多少呢(仍以上述盒子边长[0 0 0]-[1 1 1]为例)
3楼2014-10-31 10:28:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ktwyw

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
jidanaoyun: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-11-01 00:31:36
还是1sigma,不过这时的sigma既不对应A也不对应B。另外你设置cutoff的时候要具体看各种例子的直径,2.5不是万能的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好学习,天天向上。
4楼2014-10-31 19:24:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 292求调剂 +5 yhk_819 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:38 by 公瑾逍遥
[考研] 材料化工调剂 +10 今夏不夏 2026-03-01 11/550 2026-03-01 19:49 by 无懈可击111
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 12/600 2026-03-01 19:48 by 好好好1233
[考研] 306分材料调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:48 by 无际的草原
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 272求调剂 +6 材紫有化 2026-02-28 6/300 2026-03-01 18:58 by 18137688336
[考研] 281求调剂 +4 2026计算机_诚心 2026-03-01 7/350 2026-03-01 17:20 by 2026计算机_诚心
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 0856调剂 +4 刘梦微 2026-02-28 4/200 2026-03-01 15:35 by 吸一口猫气
[考研] 材料工程274求调剂 +3 Lilithan 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:58 by ms629
[考研] 284求调剂 +6 天下熯 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:19 by Ducount.Y
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考研] 寻找调剂 +4 LYidhsjabdj 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:56 by sunny81
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 10/500 2026-03-01 10:02 by 科研狗111
[考研] 材料调剂 +4 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 4/200 2026-03-01 00:38 by 猫猫球alter
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见