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lammps求小分子密度
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最近刚学lammps, 准备先算个小分子密度来verify，可能是对计算流程不是很熟悉，自己写的code有问题，好像需要再加个fix或者其他修改，大家能给点意见吗 #initialization units real atom_style full dimension 3 boundary p p p #force field information pair_style lj/cut/coul/long 12 bond_style harmonic angle_style harmonic dihedral_style opls kspace_style ewald 1e-4 read_data data.mol velocity all create 1000.0 825577 dist gaussian # settings neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 5 #thermo setting thermo_style multi timestep 2.0 #minimize min_style sd minimize 1.0e-10 1.0e-10 5000 5000 variable mass equal mass(all)/6.022e23 variable vol equal vol*1.0e-24 variable density equal v_mass/v_vol fix density all ave/time 100.0 1.0 100.0 v_density file density.mol thermo 100 thermo_style custom step temp press v_density run 1000 |
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