| 查看: 1584 | 回复: 0 | ||
[求助]
lammps求小分子密度
|
|
最近刚学lammps, 准备先算个小分子密度来verify，可能是对计算流程不是很熟悉，自己写的code有问题，好像需要再加个fix或者其他修改，大家能给点意见吗 #initialization units real atom_style full dimension 3 boundary p p p #force field information pair_style lj/cut/coul/long 12 bond_style harmonic angle_style harmonic dihedral_style opls kspace_style ewald 1e-4 read_data data.mol velocity all create 1000.0 825577 dist gaussian # settings neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 5 #thermo setting thermo_style multi timestep 2.0 #minimize min_style sd minimize 1.0e-10 1.0e-10 5000 5000 variable mass equal mass(all)/6.022e23 variable vol equal vol*1.0e-24 variable density equal v_mass/v_vol fix density all ave/time 100.0 1.0 100.0 v_density file density.mol thermo 100 thermo_style custom step temp press v_density run 1000 |
回复此楼» 猜你喜欢
基金申请
已经有44人回复
-
CSC与新西兰维多利亚大学PhD奖学金项目
已经有0人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有218人回复
-
新西兰Robinson研究所 招聘CSC公派访问人员
已经有0人回复
-
帮我的英语口语老师找学生
已经有0人回复
-
什么时候开奖？
已经有13人回复
-
散金币祈福
已经有94人回复
-
青基已中
已经有1人回复
-
散金币祈福
已经有185人回复
-
求助，如何提取ELK的rt-TDDFT在某一时刻的自旋密度分布和电子密度分布
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
Lammps计算油水界面，油相密度、平衡等问题求指导
已经有6人回复
- 用Lammps模拟计算水的密度
已经有10人回复
- 求助LAMMPS两次运算结果不一致问题！
已经有11人回复
- 请问lammps初始温度过高的问题
已经有4人回复
- 求助：lammps非周期边界
已经有22人回复
- lammps 求扩散系数 出错
已经有5人回复
- lammps势函数小疑问
已经有5人回复
- 用lammps做分子动力学新手求助
已经有6人回复
- 求助，lammps对势的应用（短程为已知函数，并且库伦长程作用，ewald求和）
已经有6人回复
- 求助LAMMPS关于MSD计算的问题
已经有17人回复
- 谁能给我解释下lammps里面neighbor list具体的意义么？
已经有3人回复
- LAMMPS是否适用于研究小型有机分子的溶剂效应？
已经有4人回复
- 寻求lammps的应用 欢迎大家畅所欲言
已经有8人回复
- 【求助】LAMMPS-运行报错
已经有9人回复
- 【求助】lammps最适合安装在哪一个版本的linux系统中？
已经有7人回复
- 【求助】lammps中多元化合物的晶格创建问题
已经有14人回复
- 【求助】MS建模导入lammps问题求救
已经有14人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
投票:
5