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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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flutebo

金虫 (小有名气)

[求助] 全基因组测序 已有2人参与

现要做真菌全基因组测序，培养真菌的过程已经加入了抑制细菌生长的抗生素，提取此真菌基因组DNA，用三对细菌通用引物（27F&1391R 、27f&342R、27f&1492R）检测是否存在细菌污染，结果每对引物都能扩出来条带，而且不止一条带！不知是否存在共生细菌？或是真菌基因组DNA就能扩出条带？或是真的是细菌污染？
做过真菌全基因组测序、或是对此了解的朋友，帮忙解答一下！谢谢！
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change,challenge,cooperation
1楼 2014-09-21 22:28:59
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
flutebo: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-09-24 22:02:57
共生的情况完全存在
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2楼2014-09-21 23:19:58
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flutebo

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Fleaves at 2014-09-21 23:19:58
共生的情况完全存在

请问怎么确定是共生的呢，现在就是不能确定是细菌污染还是共生菌的作用
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change,challenge,cooperation
3楼2014-09-22 17:16:21
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bio_sci

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-09-22 17:45:01
用的什么酶扩增的，建议做个不加dna的零对照

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2014-09-22 17:33:58
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空气也有颜色

新虫 (初入文坛)
太深啊啊
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现研究水合物资源
5楼2014-09-22 18:11:40
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flutebo

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by bio_sci at 2014-09-22 17:33:58
用的什么酶扩增的，建议做个不加dna的零对照

Takara的rtaq，做负对照了，有时负对照也有带。
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6楼2014-09-22 20:42:56
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flutebo

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 空气也有颜色 at 2014-09-22 18:11:40
太深啊啊

7楼2014-09-22 20:43:18
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Hliotrope

木虫 (著名写手)
有对照吗？用水代替模板，因为有可能你在操作过程中，试剂中混入其他菌，也能P出来的。。。
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flutebo
Someone
8楼2014-09-25 13:24:52
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flutebo

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by Hliotrope at 2014-09-25 13:24:52
有对照吗？用水代替模板，因为有可能你在操作过程中，试剂中混入其他菌，也能P出来的。。。

有，水和试剂都做了对照，样品中就是有条带，现在认为是内共生细菌，我先测一下是什么细菌，再做相应处理，谢谢你！
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9楼2014-09-28 19:53:43
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黑藻先生

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Fleaves at 2014-09-21 23:19:58
共生的情况完全存在

弱弱的问一句 细菌与细菌共生的情况也存在么？（就是分离纯化单菌种不能）
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10楼2014-10-20 19:52:19
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