24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2562  |  回复: 12

CQUTC

金虫 (小有名气)

[求助] SiO2晶体的分子模拟 已有1人参与

请问一下,在使用ms对SiO2进行动力学模拟时,从库中导入晶胞参数 a=b=0.4913 nm, c=0.54052nm的SiO2后,在此基础上构建3×3×3 的超原胞,并保持晶胞参数 a=b=0.4913 nm, c=0.54052nm,为什么不能进行动力学模拟了,总是报错Error: Dynamics: Energy difference between successive steps in dynamics is greater than the user defined variable DEVIATION,  5000.000    invoked from within"dynamics \
这是什么原因?谢谢
导入的SiO2和在此基础上构建的超晶胞如下:

SiO2晶体的分子模拟
360截图20140829121232859.jpg


SiO2晶体的分子模拟-1
360截图20140829121310015.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQUTC

金虫 (小有名气)

我看了你找的帖子,但是没有找到我遇到的问题的解决方法,你能不能帮我找一下我的问题出在哪里?
2楼2014-08-29 15:36:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuexiaoming

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by CQUTC at 2014-08-29 15:36:50
我看了你找的帖子,但是没有找到我遇到的问题的解决方法,你能不能帮我找一下我的问题出在哪里?

你在跟木虫机器说话吗   
3楼2014-08-29 15:45:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQUTC

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yuexiaoming at 2014-08-29 15:45:36
你在跟木虫机器说话吗   ...

弄错了,我还认为是虫友,你知道怎么做吗
4楼2014-08-29 15:53:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用的是Discover模块对吧。
Discover--dynamics--more 中把Energy deviation调大一些,比如5万。
如果你是用Forcite模块,也可以类似地设置。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
5楼2014-08-29 15:55:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuexiaoming

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by CQUTC at 2014-08-29 15:53:32
弄错了,我还认为是虫友,你知道怎么做吗...

没做过这方面的模拟  我也是菜鸟  一起学习
6楼2014-08-29 19:15:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQUTC

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-08-29 15:55:07
你用的是Discover模块对吧。
Discover--dynamics--more 中把Energy deviation调大一些,比如5万。
如果你是用Forcite模块,也可以类似地设置。

不行啊,那里面默认是5000,我将它设成1000或者更大都不行,我将它设小于5000也同样的报错。从库中导入的SiO2的 a=b=0.4913 nm, c=0.54052nm,我构建超晶胞后它的a=b=14.739nm,c=16.2156nm,论文上的意思是将构建超晶胞后的abc改为和导入时的一样,但是这样在分子动力学模拟时总是报错,如果我不改动,按照构建后的参数a=b=14.739nm,c=16.2156nm,这样的话在做分子动力学模拟时不会报错了,但是这样建的模型和别人论文上的就不同了,这如何是好呢?
7楼2014-08-30 09:53:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

g0701zz

新虫 (初入文坛)

哪里可以导入啊?晶胞要自己画吗?
8楼2015-05-07 21:16:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

g0701zz

新虫 (初入文坛)

晶胞 坐标是多少?si和o原子的
9楼2015-05-07 21:37:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

juanjuan0618

铜虫 (小有名气)

请问怎么得到二氧化硅晶胞呀   你用的什么势能模型
10楼2015-10-22 11:01:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 CQUTC 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +6 yexuqing 2026-04-19 7/350 2026-04-23 12:32 by yexuqing
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +18 花田半亩~白 2026-04-21 18/900 2026-04-23 11:31 by 12021227
[考研] 有没有学校收留 +3 蒋昌鹏qtj 2026-04-20 3/150 2026-04-22 20:25 by 学员JpLReM
[考研] 312求调剂 +3 山河似你温柔 2026-04-22 3/150 2026-04-22 20:17 by 学员JpLReM
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[论文投稿] 急需审稿人!!! +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见