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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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农岚沐

金虫 (小有名气)

[求助] 分子模拟中,二氧化硅纳米粒子表面处理

请教一下,在MS中,如何对纳米粒子进行表面处理,比如说,我得到一个二氧化硅纳米粒子(图一),这个粒子表面的硅原子有断裂的键,那么,我如何才能给这些硅原子加上羟基(-OH)(类似图二)?有没有相关的教程或者文献?

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我听不清,你大声点。
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yida

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 赞!鼓励交流 2013-03-10 08:42:00
用氢封闭就可以吧,就是在切表面的或者build nanocluster时勾选上cap broken bonds with H。
2楼2013-03-09 17:47:54
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农岚沐

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yida at 2013-03-09 17:47:54
用氢封闭就可以吧,就是在切表面的或者build nanocluster时勾选上cap broken bonds with H。

硅原子上的自由键不适合直接用氢封闭吧。
我是力学的,这个不是很懂,直接用氢封闭的具体原理麻烦简单讲一下。谢谢。
我听不清,你大声点。
3楼2013-03-09 20:42:08
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clwl

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-03-10 08:42:27
首先选中所有的Si原子,第二步选出有不饱和键的Si原子,第三步进行自动加氢,第四步选中所有氢原子,第五步不所有的氢原子改为氧原子,第六步再次进行自动加氢
这样就能够给加上羟基(-OH)
天道酬勤!!!
4楼2013-03-09 22:31:12
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yida

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-03-12 08:28:03
引用回帖:
3楼: Originally posted by 农岚沐 at 2013-03-09 20:42:08
硅原子上的自由键不适合直接用氢封闭吧。
我是力学的,这个不是很懂,直接用氢封闭的具体原理麻烦简单讲一下。谢谢。...

看来我错了,但是关于氢封闭的原理我倒是看过,回复貌似不能传文件,你搜下吕鑫(厦门大学化学系) 的学位论文 簇—表面类比:金属氧化物簇模型探讨 ,里边有比较详细的介绍。
5楼2013-03-10 08:56:09
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windy1991

木虫 (小有名气)

经年流转的希望

引用回帖:
4楼: Originally posted by clwl at 2013-03-09 22:31:12
首先选中所有的Si原子,第二步选出有不饱和键的Si原子,第三步进行自动加氢,第四步选中所有氢原子,第五步不所有的氢原子改为氧原子,第六步再次进行自动加氢
这样就能够给加上羟基(-OH)

那应该怎么选出不饱和键的Si原子呢?
6楼2013-03-10 13:02:24
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clwl

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by windy1991 at 2013-03-10 13:02:24
那应该怎么选出不饱和键的Si原子呢?...

Si原子饱和是成4个键,不饱和的Si成键少于4个。
当你选中所有Si原子后,按照bond count进行选择,选出成键少于4个的Si原子

20130310ݐĸ3720.jpg

天道酬勤!!!
7楼2013-03-10 14:37:16
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