24小时热门版块排行榜    

查看: 2740  |  回复: 12

CQUTC

金虫 (小有名气)

[求助] SiO2晶体的分子模拟 已有1人参与

请问一下,在使用ms对SiO2进行动力学模拟时,从库中导入晶胞参数 a=b=0.4913 nm, c=0.54052nm的SiO2后,在此基础上构建3×3×3 的超原胞,并保持晶胞参数 a=b=0.4913 nm, c=0.54052nm,为什么不能进行动力学模拟了,总是报错Error: Dynamics: Energy difference between successive steps in dynamics is greater than the user defined variable DEVIATION,  5000.000    invoked from within"dynamics \
这是什么原因?谢谢
导入的SiO2和在此基础上构建的超晶胞如下:

SiO2晶体的分子模拟
360截图20140829121232859.jpg


SiO2晶体的分子模拟-1
360截图20140829121310015.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQUTC

金虫 (小有名气)

我看了你找的帖子,但是没有找到我遇到的问题的解决方法,你能不能帮我找一下我的问题出在哪里?
2楼2014-08-29 15:36:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuexiaoming

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by CQUTC at 2014-08-29 15:36:50
我看了你找的帖子,但是没有找到我遇到的问题的解决方法,你能不能帮我找一下我的问题出在哪里?

你在跟木虫机器说话吗   
3楼2014-08-29 15:45:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQUTC

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yuexiaoming at 2014-08-29 15:45:36
你在跟木虫机器说话吗   ...

弄错了,我还认为是虫友,你知道怎么做吗
4楼2014-08-29 15:53:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用的是Discover模块对吧。
Discover--dynamics--more 中把Energy deviation调大一些,比如5万。
如果你是用Forcite模块,也可以类似地设置。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
5楼2014-08-29 15:55:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuexiaoming

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by CQUTC at 2014-08-29 15:53:32
弄错了,我还认为是虫友,你知道怎么做吗...

没做过这方面的模拟  我也是菜鸟  一起学习
6楼2014-08-29 19:15:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQUTC

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-08-29 15:55:07
你用的是Discover模块对吧。
Discover--dynamics--more 中把Energy deviation调大一些,比如5万。
如果你是用Forcite模块,也可以类似地设置。

不行啊,那里面默认是5000,我将它设成1000或者更大都不行,我将它设小于5000也同样的报错。从库中导入的SiO2的 a=b=0.4913 nm, c=0.54052nm,我构建超晶胞后它的a=b=14.739nm,c=16.2156nm,论文上的意思是将构建超晶胞后的abc改为和导入时的一样,但是这样在分子动力学模拟时总是报错,如果我不改动,按照构建后的参数a=b=14.739nm,c=16.2156nm,这样的话在做分子动力学模拟时不会报错了,但是这样建的模型和别人论文上的就不同了,这如何是好呢?
7楼2014-08-30 09:53:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

g0701zz

新虫 (初入文坛)

哪里可以导入啊?晶胞要自己画吗?
8楼2015-05-07 21:16:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

g0701zz

新虫 (初入文坛)

晶胞 坐标是多少?si和o原子的
9楼2015-05-07 21:37:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

juanjuan0618

铜虫 (小有名气)

请问怎么得到二氧化硅晶胞呀   你用的什么势能模型
10楼2015-10-22 11:01:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 CQUTC 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:45 by 4wMiSEwB6436
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:41 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +11 Tide man 2026-08-10 12/600 2026-08-15 02:12 by home3163
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 HFw0lei2R37i 2026-08-14 8/400 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
请填处理意见