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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 73 (初中生)
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性别: MM
专业: 理论和计算化学

[求助] MS-力场分配问题

我想用MS的Forcite模块做动力学，模型是一个有机分子（只包含C、H、O）在溶液盒子中，分子带了部分负电荷（羧基，含有一个C=O双键），
溶液中添加了Na离子，整体呈电中性。在做动力学之前，进行构型优化的输出文件（详见下文）提醒部分键没有分配到力场，
可是我的模型我已经用discover中的typing选项 calculate过了。请高手指教。
---- Geometry optimization parameters ----

Algorithm                      : Conjugate gradient
Convergence tolerance:
  Energy                      : 0.0001 kcal/mol
  Force                      : 0.005 kcal/mol/A
  Stress                      : 0.005 GPa
  Displacement                : 5e-005 A
Maximum number of iterations : 200
External pressure             : 0 GPa
Motion groups rigid          : NO
Optimize cell                : NO

---- Energy parameters ----

Forcefield                   : COMPASS
Electrostatic terms:
  Summation method             : Ewald
  Accuracy                   : 0.0001 kcal/mol
  Buffer width                : 0.5 A

van der Waals terms:
  Summation method             : Atom based
  Truncation method          : Cubic spline
  Cutoff distance             : 12.5 A
  Spline width                : 1 A
  Buffer width                : 0.5 A

2 bond stretch(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters.
6 inversion(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters.

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