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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 关于金属酶的同源建模
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转基因猴子

木虫 (正式写手)

[求助] 关于金属酶的同源建模 已有1人参与

各位虫子，大家好。我所改造的酶为一个金属酶，其结构内含有一个钙离子。我在同源建模的过程中发现，模板结构中是有钙离子的，但是建模结束后得到的结构文件里面没有钙离子。这个怎么办？是否有同源建模的方法可以保留这个钙离子？我使用过SWISSMODEL和I-TASSER这两个在线服务区进行同源建模。各位有何办法吗？如果不行据说可以使用VMD进行添加，但是如何添加？如果在模拟结束后就有钙离子那最好。
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我还年轻，我要上路！
1楼 2014-08-12 12:57:29
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
楼主，请问怎样确定一个酶是不是金属酶，有没有什么文献推荐
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3楼2018-10-27 12:17:20
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
转基因猴子: 金币+10, ★★★很有帮助, 好的，我试试，谢谢你的回答 2014-08-12 21:13:11
Modeller同源建模可以完成你的要求！可以试试
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2楼2014-08-12 15:21:10
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