应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 如何鉴定一种DNA样本中的不同样本类型所占百分比
181/2返回列表12下一页
查看: 2062  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

linzshit

银虫 (小有名气)

[求助] 如何鉴定一种DNA样本中的不同样本类型所占百分比 已有3人参与

现在遇到一个技术难点，举个例子就是我混合两种不同的质粒A和B，质粒之间只存在一个点的差别，我用定量的方式确定两种质粒的浓度，然后进行混合，混合方式为A/(A+B)=5%，这里的百分比是浓度比。现在问题来了，对于混合后的样本，我想鉴定它到底是不是按我预想的混合成5%了，有什么方法吗？希望大神能够解答，谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高通量测序

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-07-28 14:25:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songzuowei

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linzshit(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-07-29 11:53:10
大神的不是 可以做soutern blot
赞一下 回复此楼
2楼2014-07-28 14:33:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠萌粉

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linzshit(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-07-29 11:53:18
southern探针都比较长，单个碱基突变似乎不好做
可以试试看QPCR的方法，把突变点设置为3'最后一个碱基
A引物扩增B的 B引物扩增A的 看看能否达到区分效果（看ct值差别大不大。。）
如果质粒量比较足的话，还可以试试酶切。。
不是大神的路过
赞一下 回复此楼
3楼2014-07-28 18:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzshit

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by songzuowei at 2014-07-28 14:33:14
大神的不是 可以做soutern blot

southern的话是如何做到定量的啊，我需要精确定量到5%，这个能实现吗？
赞一下 回复此楼
4楼2014-07-29 09:16:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzshit

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 柠萌粉 at 2014-07-28 18:34:46
southern探针都比较长，单个碱基突变似乎不好做
可以试试看QPCR的方法，把突变点设置为3'最后一个碱基
A引物扩增B的 B引物扩增A的 看看能否达到区分效果（看ct值差别大不大。。）
如果质粒量比较足的话，还可以试 ...

我的模板是已经混合好的，想通过一种方式直接将混合物中两种组分都精确定量。你说的A引物检测B,B引物检测A我不太能理解，从结合效率上，这样两种引物对于单碱基突变模板的Ct变化最大在3左右，当然这是我自己做的不算定义，然后只有引物不同的话也无法收到两条扩增曲线啊，望深度指导。
赞一下 回复此楼
5楼2014-07-29 09:27:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠萌粉

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by linzshit at 2014-07-29 09:27:13
我的模板是已经混合好的，想通过一种方式直接将混合物中两种组分都精确定量。你说的A引物检测B,B引物检测A我不太能理解，从结合效率上，这样两种引物对于单碱基突变模板的Ct变化最大在3左右，当然这是我自己做的不 ...

以下都是乱想的：
1.酶切试试呢，在突变点上找个酶切位点，别的地方再找一个，做双酶切，无突变的就成线性一条带，有突变的变成两条，再用quality one 算下浓度（双酶切是因为都变成线性化的状态比较好吧）
赞一下 回复此楼
6楼2014-07-29 10:48:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzshit

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 柠萌粉 at 2014-07-29 10:48:29
以下都是乱想的：
1.酶切试试呢，在突变点上找个酶切位点，别的地方再找一个，做双酶切，无突变的就成线性一条带，有突变的变成两条，再用quality one 算下浓度（双酶切是因为都变成线性化的状态比较好吧）...

这就是我当初的设想，酶切后混合样本，然后红色和绿色引物组能分别检测其中的一种，由于两种质粒都被酶切成线性的，所以互相之间没有干扰，即使是混合以后，之后就可以按照Ct值大概的换算一下，但是实际情况是，即便是酶切结束了，也不能避免交叉检测为阴性，很蛋疼。
如何鉴定一种DNA样本中的不同样本类型所占百分比
未命名.JPG
赞一下 回复此楼
7楼2014-07-29 11:34:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠萌粉

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2 2014-07-29 19:10:18
引用回帖:
7楼: Originally posted by linzshit at 2014-07-29 11:34:11
这就是我当初的设想，酶切后混合样本，然后红色和绿色引物组能分别检测其中的一种，由于两种质粒都被酶切成线性的，所以互相之间没有干扰，即使是混合以后，之后就可以按照Ct值大概的换算一下，但是实际情况是，即 ...

不是只有一个点突变吗？怎么画成这个图的？而且即使你要用到QPCR，两对引物是不能直接进行比较的，扩增效率和产物长度不同，真要进行比较，理论上要用绝对定量，或者双标准曲线法
赞一下 回复此楼
8楼2014-07-29 12:25:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songzuowei

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by linzshit at 2014-07-29 09:16:46
southern的话是如何做到定量的啊，我需要精确定量到5%，这个能实现吗？...

这个难度就比较大了，这玩意可以确定拷贝数，但技术要求比较高
赞一下 回复此楼
9楼2014-07-29 14:25:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzshit

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 柠萌粉 at 2014-07-29 12:25:36
不是只有一个点突变吗？怎么画成这个图的？而且即使你要用到QPCR，两对引物是不能直接进行比较的，扩增效率和产物长度不同，真要进行比较，理论上要用绝对定量，或者双标准曲线法...

是只有一个突变，然后向通过两种酶切把两种分开，上面是酶切示意图，我也觉得是不能直接比较，但实在是没啥好方法了，当然这个也没成功，哈哈
绝对定量是找个标准品分别对比吗？双标准曲线法不太能理解
赞一下 回复此楼
10楼2014-07-29 15:39:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 linzshit 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 085601求调剂 +3 Du.11 2026-03-16 3/150 2026-03-16 20:42 by 无际的草原
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[教师之家] 焦虑 +7 水冰月月野兔 2026-03-13 9/450 2026-03-16 10:00 by Quakerbird
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 331求调剂（0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭