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shfujim

木虫 (正式写手)

[求助] 求助全基因组重测序数据的利用

我主要从事遗传育种,最近完成了一个物种的全基因组测序,但是不知道怎么和遗传育种联系起来。我自己查阅了一些文献,知道可以做GWAS,但是现在经费有限,没法测群体。这个方案不可行。
目前测量了一个野生型个体的基因组和一个突变型个体的基因组,想做些比较基因组学的研究,看看基因组水平的差异。

请教大虾提些其他研究内容的建议,或者推荐一些文献。
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froghama

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
shfujim: 金币+4, 谢谢回复,目前水产上的研究水平离那个还有距离,是个可以的研究方向 2014-07-16 16:25:02
可以做简化测序——基于表达谱芯片和新一代测序技术的高通量基因分型方法的开发_谢为博——看看这篇博士论文,他的测序就是简化测序,覆盖度很低,可以达到SNP分型的要求
2楼2014-07-16 09:44:00
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