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shfujim

木虫 (正式写手)

[求助] 求助全基因组重测序数据的利用

我主要从事遗传育种，最近完成了一个物种的全基因组测序，但是不知道怎么和遗传育种联系起来。我自己查阅了一些文献，知道可以做GWAS，但是现在经费有限，没法测群体。这个方案不可行。
目前测量了一个野生型个体的基因组和一个突变型个体的基因组，想做些比较基因组学的研究，看看基因组水平的差异。

请教大虾提些其他研究内容的建议，或者推荐一些文献。
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1楼 2014-07-14 16:08:00
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froghama

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
shfujim: 金币+4, 谢谢回复，目前水产上的研究水平离那个还有距离，是个可以的研究方向 2014-07-16 16:25:02
可以做简化测序——基于表达谱芯片和新一代测序技术的高通量基因分型方法的开发_谢为博——看看这篇博士论文，他的测序就是简化测序，覆盖度很低，可以达到SNP分型的要求
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2楼2014-07-16 09:44:00
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