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求大神帮忙建进化树 已有2人参与
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我用的微生物是从土壤当中提取的，DNA提取-PCR扩增获得16s rRNA，送上海生工测序获得序列。获得的序列经NCBI-Blast得到相似的序列，MEGA建进化树。（序列的方向已经调整）。但是有两株菌（WH-R1、WH-R2）无论怎么建，都不能和Blast出来的序列聚在一起，而且就像是个外群一样的。但是他们的序列相似性和同源性已经很高了。也不了解为什么就是聚不到一起来（有图）。 我又把WH-R1这株菌的序列复制成5个一样的，在MEGA里面建树，得到的进化树更加奇怪（有图，菌株名称5、6、7、8、9）。。。。 不知道有没有大神能帮我解答这个问题， 小弟感激不尽。  问题1.jpg  问题2.jpg |
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3楼2014-07-14 20:36:17
andylihuilai 
新虫 (小有名气)
- 应助: 25 (小学生)
- 金币: 137.8
- 红花: 1
- 帖子: 95
- 在线: 11.4小时
- 虫号: 1116515
- 注册: 2010-10-08
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
2楼2014-07-14 15:40:04
4楼2014-07-15 00:29:49
不知道是什么原因。。5楼2014-07-15 00:32:46
20