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fanghongmei金虫 (初入文坛)
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Amber做能量最小化时输出文件的问题
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记得以前看到过，用Amber做能量最小化时，首先进行最陡下降法进行计算，然后对体系进行共轭梯度的计算，直到min.out文件中的GMAX项达到E-01才可以进行下面的加热过程。但是我不断的增加了 最陡下降法和 共轭梯度法 的次数 ，发现自己的体系就是达不到上述要求。所以想请教各位前辈：GMAX的具体含义是什么？为什么它需要满足 E-01的要求呢？需要改变那些参数才能满足上述要求？或者各位有没有学习输出文件的相关资料呢？ 问题有点多，先谢谢大家的耐心，同时也期待大家的解答！ |
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