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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » Amber做能量最小化时输出文件的问题
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fanghongmei

金虫 (初入文坛)

[求助] Amber做能量最小化时输出文件的问题

记得以前看到过，用Amber做能量最小化时，首先进行最陡下降法进行计算，然后对体系进行共轭梯度的计算，直到min.out文件中的GMAX项达到E-01才可以进行下面的加热过程。但是我不断的增加了 最陡下降法和 共轭梯度法 的次数 ，发现自己的体系就是达不到上述要求。所以想请教各位前辈：GMAX的具体含义是什么？为什么它需要满足 E-01的要求呢？需要改变那些参数才能满足上述要求？或者各位有没有学习输出文件的相关资料呢？
        问题有点多，先谢谢大家的耐心，同时也期待大家的解答！
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1楼 2014-07-08 09:10:12
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fanghongmei

金虫 (初入文坛)
为什么没人解答呢？是我问的问题太没技术含量，所以不值得回复吗？
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2楼2014-07-10 08:46:17
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李雨婉

新虫 (小有名气)
楼主这个问题解决了吗？
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3楼2018-11-08 14:36:09
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