| 查看: 499 | 回复: 2 | |||||
mochenmi铜虫 (小有名气)
|
[求助]
蛋白预测问题 已有2人参与
|
|
通过转录组测序得到了一些表达量有变化的基因序列，想对它们做一个蛋白结构预测。 我是直接把整个序列拿去预测还是先预测一下它的ORF，然后拿ORF去预测蛋白结构呢？ 另外求常用的预测蛋白结构的软件或者网站。  |
回复此楼» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有135人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有7人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎么预测蛋白有几个结构域?
已经有8人回复
- pymol分析蛋白高级结构
已经有9人回复
- 求助----原核表达问题：实际表达的蛋白大小与预测的相差较大
已经有69人回复
- 求一些预测蛋白热稳定性的在线软件之类的，或者相关方法之类的
已经有3人回复
- 蛋白三级结构预测
已经有4人回复
- 蛋白质相互作用预测
已经有9人回复
- 如何看载体上有多少个氨基酸？预测蛋白大小？
已经有3人回复
- 怎么计算蛋白的等电点，谢谢
已经有14人回复
- 蛋白质二级结构、三级结构的预测
已经有8人回复
- 蛋白质信号肽预测的相关软件
已经有8人回复
- 原核表达 PET-30载体 目的蛋白分子量偏小？
已经有18人回复
- 蛋白质二级结构预测
已经有9人回复
- 蛋白质高级结构预测
已经有8人回复
- 点突变后蛋白结构变化预测
已经有18人回复
- 蛋白质三维结构预测
已经有10人回复
- 蛋白质3-d 结构预测
已经有3人回复
- 急求：蛋白质信息查询相关问题
已经有5人回复
- 【讨论】蛋白质从头预测最好的方法是Rosetta吗？？
已经有12人回复
- 求一个认可度较高蛋白质二级结构预测软件
已经有1人回复
飞约疯人院
专家顾问 (著名写手)
科学怪人
-
专家经验: +140 - MolEPI: 2
- 应助: 308 (大学生)
- 金币: 1083.5
- 散金: 8294
- 红花: 65
- 沙发: 5
- 帖子: 1996
- 在线: 266.1小时
- 虫号: 3188421
- 注册: 2014-05-07
- 专业: 生物化学
- 管辖: 分子生物
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mochenmi(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-06-06 19:17:58
感谢参与，应助指数 +1
mochenmi(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-06-06 19:17:58
|
http://swissmodel.expasy.org/ 这个是最经典的 但是你要先翻译成氨基酸序列 |
2楼2014-06-06 13:44:27
【答案】应助回帖
★ ★ ★
mochenmi(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-09-24 09:16:12
mochenmi(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-09-24 09:16:12
|
照我自己的经验 先预测ORF 拿到氨基酸序列 然后再去预测蛋白 我一般喜欢用在线的网站 很方便的 常用的网站 二级机构： http://www.biogem.org/tool/chou-fasman/ http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-jpred/ http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/ 三级结构： http://www.cbs.dtu.dk/services/CPHmodels/ 结构域预测： http://smart.embl-heidelberg.de http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan5/ 综合常用的一些 http://www.cbs.dtu.dk/services/ http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do http://jmol.sourceforge.net 希望能够帮助到你 |
3楼2014-09-24 08:31:41
