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新手 安装lammps出问题 求帮助
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我是lammps新手 在国外集群上安装lammps，用的是openmpi/1.6.3,安装的时候最后出现如下问题 -lreax -lpoems -lmeam -lmpi -lpthread /apps/fftw3/3.3.3/lib/libfftw3.a -ljpeg -lifcore -lsvml -lompstub -limf -lgfortran -lstdc++ -o ../lmp_linux /usr/bin/ld: cannot find -lompstub make[1]: *** [../lmp_linux] Error 1 make[1]: Leaving directory `/home/552/dxl552/xu/lammps-14Nov12/src/Obj_linux' make: *** [linux] Error 2 下面是我的Makefile.linux文件 # linux = RedHat Linux box, Intel icc, MPICH2, FFTW SHELL = /bin/sh # --------------------------------------------------------------------- # compiler/linker settings # specify flags and libraries needed for your compiler CC = icc CCFLAGS = -O SHFLAGS = -fPIC DEPFLAGS = -M LINK = icc LINKFLAGS = -O LIB = -lstdc++ SIZE = size ARCHIVE = ar ARFLAGS = -rc SHLIBFLAGS = -shared # --------------------------------------------------------------------- # LAMMPS-specific settings # specify settings for LAMMPS features you will use # if you change any -D setting, do full re-compile after "make clean" # LAMMPS ifdef settings, OPTIONAL # see possible settings in doc/Section_start.html#2_2 (step 4) LMP_INC = -DLAMMPS_GZIP -DLAMMPS_JPEG # MPI library, REQUIRED # see discussion in doc/Section_start.html#2_2 (step 5) # can point to dummy MPI library in src/STUBS as in Makefile.serial # INC = path for mpi.h, MPI compiler settings # PATH = path for MPI library # LIB = name of MPI library MPI_INC = -I/apps/openmpi/1.6.3/include/ MPI_PATH = -L/apps/openmpi/1.6.3/lib/ MPI_LIB = -lmpi -lpthread # FFT library, OPTIONAL # see discussion in doc/Section_start.html#2_2 (step 6) # can be left blank to use provided KISS FFT library # INC = -DFFT setting, e.g. -DFFT_FFTW, FFT compiler settings # PATH = path for FFT library # LIB = name of FFT library FFT_INC = -DFFT_fftw3 -I/apps/fftw3/3.3.3/include FFT_PATH = -L/apps/fftw3/3.3.3/lib FFT_LIB = /apps/fftw3/3.3.3/lib/libfftw3.a # JPEG library, OPTIONAL # see discussion in doc/Section_start.html#2_2 (step 7) # only needed if -DLAMMPS_JPEG listed with LMP_INC # INC = path for jpeglib.h # PATH = path for JPEG library # LIB = name of JPEG library JPG_INC = JPG_PATH = JPG_LIB = -ljpeg # --------------------------------------------------------------------- # build rules and dependencies # no need to edit this section include Makefile.package.settings include Makefile.package EXTRA_INC = $(LMP_INC) $(PKG_INC) $(MPI_INC) $(FFT_INC) $(JPG_INC) $(PKG_SYSINC) EXTRA_PATH = $(PKG_PATH) $(MPI_PATH) $(FFT_PATH) $(JPG_PATH) $(PKG_SYSPATH) EXTRA_LIB = $(PKG_LIB) $(MPI_LIB) $(FFT_LIB) $(JPG_LIB) $(PKG_SYSLIB) # Link target $(EXE): $(OBJ) $(LINK) $(LINKFLAGS) $(EXTRA_PATH) $(OBJ) $(EXTRA_LIB) $(LIB) -o $(EXE) $(SIZE) $(EXE) # Library targets lib: $(OBJ) $(ARCHIVE) $(ARFLAGS) $(EXE) $(OBJ) shlib: $(OBJ) $(CC) $(CCFLAGS) $(SHFLAGS) $(SHLIBFLAGS) $(EXTRA_PATH) -o $(EXE) \ $(OBJ) $(EXTRA_LIB) $(LIB) # Compilation rules %.o:%.cpp $(CC) $(CCFLAGS) $(SHFLAGS) $(EXTRA_INC) -c $< %.d:%.cpp $(CC) $(CCFLAGS) $(EXTRA_INC) $(DEPFLAGS) $< > $@ # Individual dependencies DEPENDS = $(OBJ:.o=.d) sinclude $(DEPENDS) |
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