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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体软件 » 数学构建螺旋的问题
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

[求助] 数学构建螺旋的问题 已有1人参与

数学构建螺旋模型：根据教程构建好一个EXCEL文件数据后保存为txt文件，但是如何用Daimond打开啊。教程里面说用Diamond打开xyz文件即可，我打开了几次都没成功啊。教程上这样说：

我们在 excel 中建立系列数据。列成四列： 
C1    X1    Y1    Z1 
C1    X2    Y2    Z2 
。 。 。 。 。 
另存为.txt 文件,用写字板打开文件，然后在最前面加上一个简单描述 
169（数字可变） 
Luoxuan（名称可变）; Picture 1 
保存为 Luoxuan.txt，用 diamond 中的打开时选择 XYZ 格式文件，即可。 

我构建好了数据是txt文件的，但是打不开。沮丧。。
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1楼 2014-05-22 14:37:03
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calebby

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第一行的数字是指的总共含有的原子数目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名为.xyz，然后就可以用diamond打开，楼主再试试看。
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2楼2014-05-22 15:04:49
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:04:49
第一行的数字是指的总共含有的原子数目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名为.xyz，然后就可以用diamond打开，楼主再试试看。

我构建了这样的数据，但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗？
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0.534729636        0.696961551        0.022222222
0.022222222        0.568404029        0.687938524        0.044444444
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0.022222222        0.628557522        0.653208889        0.088888889
0.022222222        0.653208889        0.628557522        0.111111111
0.022222222        0.673205081        0.6                        0.133333333
0.022222222        0.687938524        0.568404029        0.155555556
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没有捷径，只有经营
3楼2014-05-22 15:12:44
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calebby

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引用回帖:
3楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-22 15:12:44
我构建了这样的数据，但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗？
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0. ...

你的格式错了，应该是这样的：
10(所含原子的数目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列为元素种类，后三列为坐标）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****
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4楼2014-05-22 15:24:19
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
5楼2014-05-22 22:37:34
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:24:19
你的格式错了，应该是这样的：
10(所含原子的数目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列为元素种类，后三列为坐标）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****...

还是不成功。我构建了一个数据文件，请帮忙转修改成Diamond。

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C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.673205081         0.066666667
C        0.628557522         0.653208889         0.088888889
C        0.653208889         0.628557522          0.111111111
C        0.673205081         0.6                0.133333333
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C        0.7                0.5                0.2
C        0.696961551         0.465270364         0.222222222
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C        0.673205081         0.4                0.266666667
C        0.653208889         0.371442478         0.288888889
C        0.628557522         0.346791111         0.311111111
C        0.6                0.326794919         0.333333333
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C        0.465270364         0.696961551         0.777777778
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C        0.687938524         0.568404029         0.955555556
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C        0.628557522         0.346791111         1.111111111
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C        0.326794919         0.4                1.333333333
C        0.312061476         0.431595971         1.355555556
C        0.303038449         0.465270364         1.377777778
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C        0.312061476         0.568404029         1.444444444
C        0.326794919         0.6                1.466666667
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6楼2014-05-23 13:58:52
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calebby

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引用回帖:
6楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 13:58:52
还是不成功。我构建了一个数据文件，请帮忙转修改成Diamond。

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C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.6 ...

你的这一段是没有问题的，全部复制粘贴到txt文档中，保存，改名为.xyz，用diamond打开，删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了，遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索？
数学构建螺旋的问题
11.jpg
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7楼2014-05-23 14:36:34
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by calebby at 2014-05-23 14:36:34
你的这一段是没有问题的，全部复制粘贴到txt文档中，保存，改名为.xyz，用diamond打开，删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了，遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索？

11.jpg
...

ictory: 谢谢。不要这么凶。
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没有捷径，只有经营
8楼2014-05-23 16:17:12
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
再问一哈，在Diamond里面点击了connectivity后，设置里面怎么设置啊，整了几回都不成功。
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9楼2014-05-23 16:44:24
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calebby

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引用回帖:
9楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 16:44:24
再问一哈，在Diamond里面点击了connectivity后，设置里面怎么设置啊，整了几回都不成功。

你把所有的键都删除后，直接设置原子大小，把原子半径设置为一个比较合适的大小，不用成键。具体的效果见我上面的那张图。
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10楼2014-05-23 17:28:48
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[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +15 koalala 2026-08-24 17/850 2026-08-24 14:16 by hhs666
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 我面上完蛋了 +8 且听虎啸 2026-08-20 9/450 2026-08-24 13:52 by zzuzxg
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 18/900 2026-08-24 12:03 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +12 kulium 2026-08-21 15/750 2026-08-24 12:02 by iaeyuan
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 科研孤儿太难了 +18 我4大白菜 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by 凯恩广盛催化分�
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
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