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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体软件 » 数学构建螺旋的问题
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

[求助] 数学构建螺旋的问题 已有1人参与

数学构建螺旋模型：根据教程构建好一个EXCEL文件数据后保存为txt文件，但是如何用Daimond打开啊。教程里面说用Diamond打开xyz文件即可，我打开了几次都没成功啊。教程上这样说：

我们在 excel 中建立系列数据。列成四列： 
C1    X1    Y1    Z1 
C1    X2    Y2    Z2 
。 。 。 。 。 
另存为.txt 文件,用写字板打开文件，然后在最前面加上一个简单描述 
169（数字可变） 
Luoxuan（名称可变）; Picture 1 
保存为 Luoxuan.txt，用 diamond 中的打开时选择 XYZ 格式文件，即可。 

我构建好了数据是txt文件的，但是打不开。沮丧。。
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1楼 2014-05-22 14:37:03
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calebby

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第一行的数字是指的总共含有的原子数目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名为.xyz，然后就可以用diamond打开，楼主再试试看。
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2楼2014-05-22 15:04:49
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:04:49
第一行的数字是指的总共含有的原子数目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名为.xyz，然后就可以用diamond打开，楼主再试试看。

我构建了这样的数据，但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗？
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0.534729636        0.696961551        0.022222222
0.022222222        0.568404029        0.687938524        0.044444444
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0.022222222        0.628557522        0.653208889        0.088888889
0.022222222        0.653208889        0.628557522        0.111111111
0.022222222        0.673205081        0.6                        0.133333333
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没有捷径，只有经营
3楼2014-05-22 15:12:44
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calebby

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引用回帖:
3楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-22 15:12:44
我构建了这样的数据，但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗？
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0. ...

你的格式错了，应该是这样的：
10(所含原子的数目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列为元素种类，后三列为坐标）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****
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4楼2014-05-22 15:24:19
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
5楼2014-05-22 22:37:34
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:24:19
你的格式错了，应该是这样的：
10(所含原子的数目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列为元素种类，后三列为坐标）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****...

还是不成功。我构建了一个数据文件，请帮忙转修改成Diamond。

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C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.673205081         0.066666667
C        0.628557522         0.653208889         0.088888889
C        0.653208889         0.628557522          0.111111111
C        0.673205081         0.6                0.133333333
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C        0.7                0.5                0.2
C        0.696961551         0.465270364         0.222222222
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C        0.653208889         0.371442478         0.288888889
C        0.628557522         0.346791111         0.311111111
C        0.6                0.326794919         0.333333333
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C        0.687938524         0.568404029         0.955555556
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C        0.628557522         0.346791111         1.111111111
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C        0.326794919         0.4                1.333333333
C        0.312061476         0.431595971         1.355555556
C        0.303038449         0.465270364         1.377777778
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C        0.312061476         0.568404029         1.444444444
C        0.326794919         0.6                1.466666667
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6楼2014-05-23 13:58:52
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calebby

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引用回帖:
6楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 13:58:52
还是不成功。我构建了一个数据文件，请帮忙转修改成Diamond。

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C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.6 ...

你的这一段是没有问题的，全部复制粘贴到txt文档中，保存，改名为.xyz，用diamond打开，删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了，遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索？
数学构建螺旋的问题
11.jpg
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7楼2014-05-23 14:36:34
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by calebby at 2014-05-23 14:36:34
你的这一段是没有问题的，全部复制粘贴到txt文档中，保存，改名为.xyz，用diamond打开，删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了，遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索？

11.jpg
...

ictory: 谢谢。不要这么凶。
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没有捷径，只有经营
8楼2014-05-23 16:17:12
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)
再问一哈，在Diamond里面点击了connectivity后，设置里面怎么设置啊，整了几回都不成功。
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9楼2014-05-23 16:44:24
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calebby

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引用回帖:
9楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 16:44:24
再问一哈，在Diamond里面点击了connectivity后，设置里面怎么设置啊，整了几回都不成功。

你把所有的键都删除后，直接设置原子大小，把原子半径设置为一个比较合适的大小，不用成键。具体的效果见我上面的那张图。
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10楼2014-05-23 17:28:48
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