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汕头大学海洋科学接受调剂
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

[求助] 数学构建螺旋的问题 已有1人参与

数学构建螺旋模型:根据教程构建好一个EXCEL文件数据后保存为txt文件,但是如何用Daimond打开啊。教程里面说用Diamond打开xyz文件即可,我打开了几次都没成功啊。教程上这样说:

我们在 excel 中建立系列数据。列成四列: 
C1    X1    Y1    Z1 
C1    X2    Y2    Z2 
。 。 。 。 。 
另存为.txt 文件,用写字板打开文件,然后在最前面加上一个简单描述 
169(数字可变) 
Luoxuan(名称可变); Picture 1 
保存为 Luoxuan.txt,用 diamond 中的打开时选择 XYZ 格式文件,即可。 

我构建好了数据是txt文件的,但是打不开。沮丧。。
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calebby

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第一行的数字是指的总共含有的原子数目,第二列可以不填,最后直接把.txt重命名为.xyz,然后就可以用diamond打开,楼主再试试看。
2楼2014-05-22 15:04:49
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:04:49
第一行的数字是指的总共含有的原子数目,第二列可以不填,最后直接把.txt重命名为.xyz,然后就可以用diamond打开,楼主再试试看。

我构建了这样的数据,但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗?
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0.534729636        0.696961551        0.022222222
0.022222222        0.568404029        0.687938524        0.044444444
0.022222222        0.6                        0.673205081        0.066666667
0.022222222        0.628557522        0.653208889        0.088888889
0.022222222        0.653208889        0.628557522        0.111111111
0.022222222        0.673205081        0.6                        0.133333333
0.022222222        0.687938524        0.568404029        0.155555556
0.022222222        0.696961551        0.534729636        0.177777778
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没有捷径,只有经营
3楼2014-05-22 15:12:44
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calebby

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引用回帖:
3楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-22 15:12:44
我构建了这样的数据,但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗?
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0. ...

你的格式错了,应该是这样的:
10(所含原子的数目)
***(可以不填)
C X1 Y1 Z1(第一列为元素种类,后三列为坐标)
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****
4楼2014-05-22 15:24:19
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

5楼2014-05-22 22:37:34
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:24:19
你的格式错了,应该是这样的:
10(所含原子的数目)
***(可以不填)
C X1 Y1 Z1(第一列为元素种类,后三列为坐标)
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****...

还是不成功。我构建了一个数据文件,请帮忙转修改成Diamond。

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C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.673205081         0.066666667
C        0.628557522         0.653208889         0.088888889
C        0.653208889         0.628557522          0.111111111
C        0.673205081         0.6                0.133333333
C        0.687938524         0.568404029         0.155555556
C        0.696961551         0.534729636         0.177777778
C        0.7                0.5                0.2
C        0.696961551         0.465270364         0.222222222
C        0.687938524         0.431595971         0.244444444
C        0.673205081         0.4                0.266666667
C        0.653208889         0.371442478         0.288888889
C        0.628557522         0.346791111         0.311111111
C        0.6                0.326794919         0.333333333
C        0.568404029         0.312061476         0.355555556
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C        0.687938524         0.326794919         0.466666667
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C        0.5                0.7                0.8
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C        0.312061476         0.431595971         1.355555556
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没有捷径,只有经营
6楼2014-05-23 13:58:52
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calebby

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【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 13:58:52
还是不成功。我构建了一个数据文件,请帮忙转修改成Diamond。

101
         
C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.6 ...

你的这一段是没有问题的,全部复制粘贴到txt文档中,保存,改名为.xyz,用diamond打开,删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了,遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索?
数学构建螺旋的问题
11.jpg

7楼2014-05-23 14:36:34
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by calebby at 2014-05-23 14:36:34
你的这一段是没有问题的,全部复制粘贴到txt文档中,保存,改名为.xyz,用diamond打开,删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了,遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索?

11.jpg
...

ictory: 谢谢。不要这么凶。
没有捷径,只有经营
8楼2014-05-23 16:17:12
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

再问一哈,在Diamond里面点击了connectivity后,设置里面怎么设置啊,整了几回都不成功。
没有捷径,只有经营
9楼2014-05-23 16:44:24
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calebby

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【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 16:44:24
再问一哈,在Diamond里面点击了connectivity后,设置里面怎么设置啊,整了几回都不成功。

你把所有的键都删除后,直接设置原子大小,把原子半径设置为一个比较合适的大小,不用成键。具体的效果见我上面的那张图。
10楼2014-05-23 17:28:48
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[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
[考研] 346分,工科0854求调剂,专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
[考研] 339求调剂 +8 hanwudada 2026-04-11 9/450 2026-04-12 15:36 by laoshidan
[考研] 求调剂,一志愿材料科学与工程985,365分, +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
[考研] 280求调剂 +7 兮兮夜夜 2026-04-09 10/500 2026-04-12 00:33 by 蓝云思雨
[考研] 电子信息279求调剂,有书读就行 +8 wwwooden 2026-04-08 11/550 2026-04-11 20:22 by cq2548
[考研] 求调剂,一志愿大连理工大学354分 +5 雨声余生 2026-04-11 6/300 2026-04-11 16:12 by 雨声余生
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[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +16 叶zilin 2026-04-10 16/800 2026-04-11 11:04 by may_新宇
[考研] 求调剂 +6 archer.. 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:55 by zhq0425
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[考研] 一志愿北理工298英一数二已上岸,感谢各位老师 +14 Reframe 2026-04-10 16/800 2026-04-10 23:07 by caotw2020
[考研] 0858求调剂 5+5 Gky09300550, 2026-04-10 8/400 2026-04-10 19:13 by chemisry
[考研] 机械调剂 +3 zzzbcb 2026-04-07 3/150 2026-04-07 22:19 by hemengdong
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