应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体软件 » 数学构建螺旋的问题
111/2返回列表12下一页
查看: 1256  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhanghuayi

金虫 (正式写手)

[求助] 数学构建螺旋的问题 已有1人参与

数学构建螺旋模型：根据教程构建好一个EXCEL文件数据后保存为txt文件，但是如何用Daimond打开啊。教程里面说用Diamond打开xyz文件即可，我打开了几次都没成功啊。教程上这样说：

我们在 excel 中建立系列数据。列成四列： 
C1    X1    Y1    Z1 
C1    X2    Y2    Z2 
。 。 。 。 。 
另存为.txt 文件,用写字板打开文件，然后在最前面加上一个简单描述 
169（数字可变） 
Luoxuan（名称可变）; Picture 1 
保存为 Luoxuan.txt，用 diamond 中的打开时选择 XYZ 格式文件，即可。 

我构建好了数据是txt文件的，但是打不开。沮丧。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
没有捷径，只有经营
1楼 2014-05-22 14:37:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
第一行的数字是指的总共含有的原子数目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名为.xyz，然后就可以用diamond打开，楼主再试试看。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2014-05-22 15:04:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:04:49
第一行的数字是指的总共含有的原子数目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名为.xyz，然后就可以用diamond打开，楼主再试试看。

我构建了这样的数据，但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗？
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0.534729636        0.696961551        0.022222222
0.022222222        0.568404029        0.687938524        0.044444444
0.022222222        0.6                        0.673205081        0.066666667
0.022222222        0.628557522        0.653208889        0.088888889
0.022222222        0.653208889        0.628557522        0.111111111
0.022222222        0.673205081        0.6                        0.133333333
0.022222222        0.687938524        0.568404029        0.155555556
0.022222222        0.696961551        0.534729636        0.177777778
0.022222222        0.7                         0.5                         0.2
赞一下 回复此楼
没有捷径，只有经营
3楼2014-05-22 15:12:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

calebby

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-22 15:12:44
我构建了这样的数据，但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗？
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0. ...

你的格式错了，应该是这样的：
10(所含原子的数目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列为元素种类，后三列为坐标）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****
赞一下 回复此楼
4楼2014-05-22 15:24:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanghuayi

金虫 (正式写手)
5楼2014-05-22 22:37:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:24:19
你的格式错了，应该是这样的：
10(所含原子的数目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列为元素种类，后三列为坐标）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****...

还是不成功。我构建了一个数据文件，请帮忙转修改成Diamond。

101
         
C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.673205081         0.066666667
C        0.628557522         0.653208889         0.088888889
C        0.653208889         0.628557522          0.111111111
C        0.673205081         0.6                0.133333333
C        0.687938524         0.568404029         0.155555556
C        0.696961551         0.534729636         0.177777778
C        0.7                0.5                0.2
C        0.696961551         0.465270364         0.222222222
C        0.687938524         0.431595971         0.244444444
C        0.673205081         0.4                0.266666667
C        0.653208889         0.371442478         0.288888889
C        0.628557522         0.346791111         0.311111111
C        0.6                0.326794919         0.333333333
C        0.568404029         0.312061476         0.355555556
C        0.534729636         0.303038449         0.377777778
C        0.5                0.3                0.4
C        0.465270364         0.303038449         0.422222222
C        0.431595971         0.312061476         0.444444444
C        0.687938524         0.326794919         0.466666667
C        0.371442478         0.346791111         0.488888889
C        0.346791111         0.371442478         0.511111111
C        0.326794919         0.4                0.533333333
C        0.312061476         0.431595971         0.555555556
C        0.303038449         0.465270364         0.577777778
C        0.3                0.5                0.6
C        0.303038449         0.534729636         0.622222222
C        0.312061476         0.568404029         0.644444444
C        0.326794919         0.6                0.666666667
C        0.346791111         0.628557522         0.688888889
C        0.371442478         0.653208889         0.711111111
C        0.4                0.673205081         0.733333333
C        0.431595971         0.687938524         0.755555556
C        0.465270364         0.696961551         0.777777778
C        0.5                0.7                0.8
C        0.534729636         0.696961551         0.822222222
C        0.568404029         0.687938524         0.844444444
C        0.6                0.673205081         0.866666667
C        0.628557522         0.653208889         0.888888889
C        0.653208889         0.628557522         0.911111111
C        0.673205081         0.6                0.933333333
C        0.687938524         0.568404029         0.955555556
C        0.696961551         0.534729636         0.977777778
C        0.7                0.5                1
C        0.696961551         0.465270364         1.022222222
C        0.687938524         0.431595971         1.044444444
C        0.673205081         0.4                1.066666667
C        0.653208889         0.371442478         1.088888889
C        0.628557522         0.346791111         1.111111111
C        0.6                0.326794919         1.133333333
C        0.568404029         0.312061476         1.155555556
C        0.534729636         0.303038449         1.177777778
C        0.5                0.3                1.2
C        0.465270364         0.303038449         1.222222222
C        0.431595971         0.312061476         1.244444444
C        0.4                0.326794919         1.266666667
C        0.371442478         0.346791111         1.288888889
C        0.346791111         0.371442478         1.311111111
C        0.326794919         0.4                1.333333333
C        0.312061476         0.431595971         1.355555556
C        0.303038449         0.465270364         1.377777778
C        0.3                0.5                1.4
C        0.303038449         0.534729636         1.422222222
C        0.312061476         0.568404029         1.444444444
C        0.326794919         0.6                1.466666667
C        0.346791111         0.628557522         1.488888889
C        0.371442478         0.653208889         1.511111111
C        0.4                0.673205081         1.533333333
C        0.431595971         0.687938524         1.555555556
C        0.465270364         0.696961551         1.577777778
C        0.5                0.7                1.6
C        0.534729636         0.696961551         1.622222222
C        0.568404029         0.687938524         1.644444444
C        0.6                0.673205081         1.666666667
C        0.628557522         0.653208889         1.688888889
C        0.653208889         0.628557522         1.711111111
C        0.673205081         0.6                1.733333333
C        0.687938524         0.568404029         1.755555556
C        0.696961551         0.534729636         1.777777778
C        0.7                0.5                1.8
C        0.696961551         0.465270364         1.822222222
C        0.687938524         0.431595971         1.844444444
C        0.673205081         0.4                1.866666667
C        0.653208889         0.371442478         1.888888889
C        0.628557522         0.346791111         1.911111111
C        0.6                0.326794919         1.933333333
C        0.568404029         0.312061476         1.955555556
C        0.534729636         0.303038449         1.977777778
C        0.5                0.3                2
C        0.465270364         0.303038449   2.022222222
C        0.431595971         0.312061476         2.044444444
C        0.4                0.326794919         2.066666667
C        0.371442478         0.346791111         2.088888889
C        0.346791111         0.371442478         2.111111111
C        0.326794919         0.4                2.133333333
C        0.312061476         0.431595971         2.155555556
C        0.303038449         0.465270364         2.177777778
C        0.3                0.5                2.2
C        0.303038449         0.534729636         2.222222222
赞一下 回复此楼
没有捷径，只有经营
6楼2014-05-23 13:58:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 13:58:52
还是不成功。我构建了一个数据文件，请帮忙转修改成Diamond。

101
         
C        0.5                0.5                0
C        0.534729636         0.696961551         0.022222222
C        0.568404029         0.687938524         0.044444444
C        0.6                0.6 ...

你的这一段是没有问题的，全部复制粘贴到txt文档中，保存，改名为.xyz，用diamond打开，删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了，遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索？
数学构建螺旋的问题
11.jpg
赞一下 回复此楼
7楼2014-05-23 14:36:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanghuayi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by calebby at 2014-05-23 14:36:34
你的这一段是没有问题的，全部复制粘贴到txt文档中，保存，改名为.xyz，用diamond打开，删除掉所有的键就成了。方法都告诉你了，遇到了一点小麻烦难道不能自己再摸索摸索？

11.jpg
...

ictory: 谢谢。不要这么凶。
赞一下 回复此楼
没有捷径，只有经营
8楼2014-05-23 16:17:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanghuayi

金虫 (正式写手)
再问一哈，在Diamond里面点击了connectivity后，设置里面怎么设置啊，整了几回都不成功。
赞一下 回复此楼
没有捷径，只有经营
9楼2014-05-23 16:44:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 16:44:24
再问一哈，在Diamond里面点击了connectivity后，设置里面怎么设置啊，整了几回都不成功。

你把所有的键都删除后，直接设置原子大小，把原子半径设置为一个比较合适的大小，不用成键。具体的效果见我上面的那张图。
赞一下 回复此楼
10楼2014-05-23 17:28:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhanghuayi 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +10 枫桥ZL 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:02 by peike
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +5 张vvvv 2026-03-15 7/350 2026-03-21 19:23 by ColorlessPI
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-16 3/150 2026-03-21 03:59 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +3 Jack?k?y 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:17 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 5/250 2026-03-20 22:11 by 云游重阳
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生（接收计算机专业调剂） +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 招收调剂硕士 +4 lidianxing 2026-03-19 12/600 2026-03-20 12:25 by lidianxing
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂（0854都可以） +4 xbxudjdn 2026-03-18 4/200 2026-03-20 09:07 by 不168
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭