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汕头大学海洋科学接受调剂
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

[求助] 数学构建螺旋的问题 已有1人参与

数学构建螺旋模型:根据教程构建好一个EXCEL文件数据后保存为txt文件,但是如何用Daimond打开啊。教程里面说用Diamond打开xyz文件即可,我打开了几次都没成功啊。教程上这样说:

我们在 excel 中建立系列数据。列成四列: 
C1    X1    Y1    Z1 
C1    X2    Y2    Z2 
。 。 。 。 。 
另存为.txt 文件,用写字板打开文件,然后在最前面加上一个简单描述 
169(数字可变) 
Luoxuan(名称可变); Picture 1 
保存为 Luoxuan.txt,用 diamond 中的打开时选择 XYZ 格式文件,即可。 

我构建好了数据是txt文件的,但是打不开。沮丧。。
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calebby

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【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 16:44:24
再问一哈,在Diamond里面点击了connectivity后,设置里面怎么设置啊,整了几回都不成功。

你把所有的键都删除后,直接设置原子大小,把原子半径设置为一个比较合适的大小,不用成键。具体的效果见我上面的那张图。
10楼2014-05-23 17:28:48
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
第一行的数字是指的总共含有的原子数目,第二列可以不填,最后直接把.txt重命名为.xyz,然后就可以用diamond打开,楼主再试试看。
2楼2014-05-22 15:04:49
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zhanghuayi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:04:49
第一行的数字是指的总共含有的原子数目,第二列可以不填,最后直接把.txt重命名为.xyz,然后就可以用diamond打开,楼主再试试看。

我构建了这样的数据,但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗?
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0.534729636        0.696961551        0.022222222
0.022222222        0.568404029        0.687938524        0.044444444
0.022222222        0.6                        0.673205081        0.066666667
0.022222222        0.628557522        0.653208889        0.088888889
0.022222222        0.653208889        0.628557522        0.111111111
0.022222222        0.673205081        0.6                        0.133333333
0.022222222        0.687938524        0.568404029        0.155555556
0.022222222        0.696961551        0.534729636        0.177777778
0.022222222        0.7                         0.5                         0.2
没有捷径,只有经营
3楼2014-05-22 15:12:44
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-22 15:12:44
我构建了这样的数据,但是重命名xyz格式后依然打不开呀。可以私聊吗?
169
c                        x                        y                        z
0.022222222        0.5                        0.5                        0
0.022222222        0. ...

你的格式错了,应该是这样的:
10(所含原子的数目)
***(可以不填)
C X1 Y1 Z1(第一列为元素种类,后三列为坐标)
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****
4楼2014-05-22 15:24:19
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