应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何判定蛋白保守区域？
31/1返回列表
查看: 7472  |  回复: 2
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chenxiang29

银虫 (正式写手)

[求助] 如何判定蛋白保守区域？已有1人参与

我获得了一条新基因，翻译成蛋白后，通过blast比对发现，有一条序列与之一致性为69%，都是血红蛋白家族，那请问如何判定保守区域呢？我已经用clustal x和DNAman分析一致性较高的5种蛋白，有部分序列是相同的，那怎么确定是保守区域呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
smile to the world
1楼2014-05-20 21:31:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-05-20 23:26:26
1.一般你做多序列比对后，相同的序列很可能就是保守区。
2.可以用EMBL的SMART或InterProScan（http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/）或ExPASy的PROSITE（http://prosite.expasy.org/）等在线工具分析蛋白序列的结构域及功能位点，结构域及功能位点一般为保守区。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2014-05-20 22:12:10
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenxiang29

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-20 22:12:10
1.一般你做多序列比对后，相同的序列很可能就是保守区。
2.可以用EMBL的SMART或InterProScan（http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/）或ExPASy的PROSITE（http://prosite.expasy.org/）等在线工具分析蛋白序列 ...

非常感谢
回复此楼
smile to the world
3楼2014-05-21 16:01:18
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chenxiang29 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭