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chenxiang29银虫 (正式写手)
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如何判定蛋白保守区域？已有1人参与
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| 我获得了一条新基因，翻译成蛋白后，通过blast比对发现，有一条序列与之一致性为69%，都是血红蛋白家族，那请问如何判定保守区域呢？我已经用clustal x和DNAman分析一致性较高的5种蛋白，有部分序列是相同的，那怎么确定是保守区域呢？ |
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-05-20 23:26:26
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1.一般你做多序列比对后，相同的序列很可能就是保守区。 2.可以用EMBL的SMART或InterProScan（http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/）或ExPASy的PROSITE（http://prosite.expasy.org/）等在线工具分析蛋白序列的结构域及功能位点，结构域及功能位点一般为保守区。 |
2楼2014-05-20 22:12:10
chenxiang29
银虫 (正式写手)
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3楼2014-05-21 16:01:18