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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS Dmol3模块进行COSMO计算问题~
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pdl9527

专家顾问 (小有名气)

[求助] MS Dmol3模块进行COSMO计算问题~

我按照附件中的方法一步一步的算propane的σ-profile但是算出来总是只有一个峰，实际上是有两个峰的（用MS7.0最后他会自动给出σ-profile的图，可以不用他的程序计算）
算其他分子也有一样的问题，不知道什么原因，有大神帮忙解答一下么~~
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  • 附件 1 : VT-2005_Sigma_Profile_Generation_Procedure.pdf
    • 2014-05-13 18:24:17, 1.81 M

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1楼 2014-05-13 18:24:27
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pdl9527

专家顾问 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sfycong at 2014-10-14 16:26:47
楼主，你用ms7.0中的Cosmo是怎么算的？有没有修改input文件，如果不修改的话，MS自动会给出sigma--profile，我算H2O的sigma--profile是，溶剂选的还是水，也没有修改input文件，这样算出来的结果和文献给出的水的si ...

你结合我附件中的教程加上  “基于COSMO-SAC模型和分子模拟预测复杂系统热力学性质” 这篇博士学位论文里面P14-P15的input命令，然后注意一下MS中不同版本A.U和A单位的转换就行了。
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5楼2014-10-15 08:16:36
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jiehuimin

金虫 (小有名气)
我也碰到这个问题，有没人给解答下，还有7.0里的σ-profile图是基于哪个方法算的。
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不以物喜，不以己悲。
2楼2014-07-12 13:17:26
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pdl9527

专家顾问 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiehuimin at 2014-07-12 13:17:26
我也碰到这个问题，有没人给解答下，还有7.0里的σ-profile图是基于哪个方法算的。

你可以看我另外一个帖子，是单位的问题~
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3楼2014-07-12 19:05:41
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sfycong

新虫 (初入文坛)
楼主，你用ms7.0中的Cosmo是怎么算的？有没有修改input文件，如果不修改的话，MS自动会给出sigma--profile，我算H2O的sigma--profile是，溶剂选的还是水，也没有修改input文件，这样算出来的结果和文献给出的水的sigma--profile有很大的差距啊！望楼主指点迷津，另外楼主有没有MS7.0版本的关于Cosmo计算溶剂化效应的详细教程呢？
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4楼2014-10-14 16:26:47
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