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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子动力学用哪个模块
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2007280038037

银虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学用哪个模块

进行分子动力学模拟，目的想知道一个分子在多孔材料笼内是否会与笼上的金属原子配位，用MS的哪个模块啊？
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1楼2012-09-21 09:17:21
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未央于一

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-09-23 12:55:04
2007280038037: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-09-23 18:51:46
分子动力学模拟使用DMol3模块，至于你后面说的东东我就不知道了
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2楼2012-09-23 12:39:39
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gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-09-23 18:03:28
2007280038037: 金币+1 2012-09-23 18:52:00
Discover或Forcite模块做经验力场模拟，DMol3模块做从头算模拟
赞一下(1人) 回复此楼
一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
3楼2012-09-23 14:27:38
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2007280038037

银虫 (小有名气)
问了工程师，是用DMOL3计算，但是计算过程中，哪位大侠知道如何设置才能监测到目标两个原子的距离变化啊
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4楼2012-09-23 19:49:40
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2007280038037

银虫 (小有名气)
Warning, sas solver return  1.9308  2.4566
Warning, sas solver return  1.9179  2.4566
Warning, sas solver return  2.7635  3.7795
Error: maxnps csasg     3552        0        0     3551
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
哪位大侠帮忙指点一下，为什么错误
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5楼2012-10-08 09:55:08
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514156130

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 2007280038037 at 2012-10-08 09:55:08
Warning, sas solver return  1.9308  2.4566
Warning, sas solver return  1.9179  2.4566
Warning, sas solver return  2.7635  3.7795
Error: maxnps csasg     3552        0        0     3551
Message: D ...

Integration points, checksum  0     24126     96051     113.000686
cubic simple grid used for COSMO
find_acc  sas_alf=   50.00
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
Error: maxnps csasg      829        0        0      828
我也遇到这个问题
应该是加COSMO导致的  不知道楼主解决了没有
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6楼2013-11-11 15:42:58
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