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qiushuimeng

新虫 (著名写手)

[求助] 已知一个启动子序列,怎么知道它是否为特异性的? 已有5人参与

如题,已经获得一个启动子了,想知道它是否为特异性,是通过信息学分析呢还是通过实验?请各位大侠帮帮我这个毫无头绪的初学者吧?学的太差,请大家别笑话!谢谢!
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追随自由的心

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-09 22:52:20
引用回帖:
5楼: Originally posted by qiushuimeng at 2014-05-08 17:37:01
谢谢你哈,做序列分析了,没发现什么呢。这位大侠,我说说我的思路你帮我看看对不对哈,假如是某个植物中的启动子,然后想知道它是不是组织特异性,比如是否只在胚珠中表达,可否通过反转录得到这个植株的各 ...

如果是想做表达谱分析,建议克隆启动子序列,然后加上GUS报告基因,将载体转染你的植物,然后通过检测GUS的活性,可以具体看哪个组织,生长发育时期的特异性表达。其实研究启动子的方法有很多,比如酵母单杂,找蛋白与启动子结合的特异性,EMSA研究蛋白具体 与那几个特异碱基结合,promoter序列比对,肯定会有信息的,那种的box啊elements啊,或者其他的。
快乐也是一种能力
9楼2014-05-09 10:30:22
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
什么物种?你指的特异性是什么意思?
2楼2014-05-08 07:50:21
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-05-08 12:15:03
生物信息学就是序列分析和对比了
一般情况下,这种应该进行细胞转染实验
用你的启动子去启动一个荧光蛋白,然后看其表达的荧光蛋白分布

如果你是做动物的,那就是要做克隆了,在动物中表达
天行健
3楼2014-05-08 09:48:18
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qiushuimeng

新虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by meng_xu at 2014-05-08 07:50:21
什么物种?你指的特异性是什么意思?

假如是某个植物中的启动子,然后想知道它是不是组织特异性,比如是否只在胚珠中表达,怎么弄?谢谢
4楼2014-05-08 17:26:19
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