24小时热门版块排行榜    

查看: 1929  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

HOLLYHUI

金虫 (小有名气)

[求助] 如何发现新基因 已有3人参与

本人的研究方向是细菌降解木质素,课题组筛选出一株新菌能够降解木质素,已经对其进行了全基因组测序,并且数据已经整理好,但是如何在庞大的数据中发现参与木质素降解的新基因,求高手指点,万分感谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

回不去的曾经······
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

建议做改菌株的突变体库,有表型了,再考察基因型

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-05-13 15:10:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

geminiooalh

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2014-05-13 13:40:27
最近也遇到这个问题。
大概查了下文献,不知道下面这些能不能实现这个目的:
1、既然有全基因组信息,那是不是可以通过基因注释,排除大部分不相关基因;
2、提取降解过程中细菌的RNA,通过real-time考察是否有表达差异,选择具有明显表达差异的序列加上之前基因注释的结果,排除不相关序列;
3、剩余序列信息,再通过常规克隆筛选到相应目的基因序列信息
以上仅为个人拙见,也希望有大神指点。谢谢
2楼2014-05-13 13:17:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzyzeus

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

我的大体思路是做RNA-seq
来个全转录组测序,然后用相应的RNA片段数目表示其基因表达水平
与注释文件相比较,注释文件中已经注明基因了的座位有表达量不稀奇,但是没有注释的座位在你的实验中具有一定的表达水平可以反映这个是新基因
4楼2014-05-13 20:37:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料复试调剂 +4 学材料的点 2026-03-01 5/250 2026-03-02 08:26 by houyaoxu
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +4 pin8023 2026-02-28 6/300 2026-03-02 06:35 by 汪!?!
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:31 by L135790
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 0856求调剂285 +10 吕仔龙 2026-02-28 10/500 2026-03-01 21:37 by 公瑾逍遥
[考研] 299求调剂 +3 Y墨明棋妙Y 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:01 by tangxiaotian
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 化工专硕348,一志愿985求调剂 +5 弗格个 2026-02-28 8/400 2026-03-01 17:25 by sunny81
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[基金申请] 刚录用,没有期刊号,但是在线可看的论文可以放为代表作吗 10+3 arang1 2026-03-01 3/150 2026-03-01 16:43 by babero
[考研] 313求调剂 +3 水流年lc 2026-02-28 3/150 2026-03-01 16:01 by 新能源达人
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-02-28 7/350 2026-03-01 15:14 by wjLi2017
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业,申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
信息提示
请填处理意见