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HOLLYHUI

金虫 (小有名气)

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[求助] 如何发现新基因已有3人参与

本人的研究方向是细菌降解木质素，课题组筛选出一株新菌能够降解木质素，已经对其进行了全基因组测序，并且数据已经整理好，但是如何在庞大的数据中发现参与木质素降解的新基因，求高手指点，万分感谢！

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回不去的曾经······

1楼 2014-05-06 21:49:53

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geminiooalh

铁虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2014-05-13 13:40:27

最近也遇到这个问题。
大概查了下文献，不知道下面这些能不能实现这个目的：
1、既然有全基因组信息，那是不是可以通过基因注释，排除大部分不相关基因；
2、提取降解过程中细菌的RNA，通过real-time考察是否有表达差异，选择具有明显表达差异的序列加上之前基因注释的结果，排除不相关序列；
3、剩余序列信息，再通过常规克隆筛选到相应目的基因序列信息
以上仅为个人拙见，也希望有大神指点。谢谢

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