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tina2013liti

新虫 (初入文坛)

[求助] 对产电菌进行荧光PCR定量，让生工设计引物，他们说要针对具体基因 已有1人参与

DGGE分析出来，有产电菌Geobacter metallireducens，想用荧光定量PCR进行定量，应该怎样设计引物呢？让上海生工给设计，但是他们问：“根据那些基因进行设计？不知道细菌的报告基因，不能设计。”这可怎么办呢？不能根据菌种及其基因序列进行设计引物吗，要给生工什么，他们才肯设计呢
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1楼 2014-04-22 19:25:52
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tina2013liti

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-04-23 16:10:43
可以的，你自己要提交序列啊，生工肯定不会给你设计序列的，他们只会合成！

将你的这个材料所有的物种的16S选择出来，然后选一些近源的物种的16S,比对一下，挑合适的进行设计就可以了...

生工说，他们只会根据基因进行设计，16s同源性太高，他们不设计。你是说，把DGGE结果的DNA测序出来的所有物种的16S找出来，选择一些相对特异性的片段，让生工给设计吗
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5楼2014-04-24 09:25:32
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助！ 2014-04-23 17:58:10
你要根据你的菌株设计特异性探针，建议你读读文献先！可能你要做的是根据你的细菌设计特异性的16S rDNA探针~
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致良知
2楼2014-04-22 23:32:09
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tina2013liti

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-04-22 23:32:09
你要根据你的菌株设计特异性探针，建议你读读文献先！可能你要做的是根据你的细菌设计特异性的16S rDNA探针~

我想根据16S设计引物，但是生工说不能设计，只能看文献了
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3楼2014-04-23 10:41:31
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quiller2000

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by tina2013liti at 2014-04-23 10:41:31
我想根据16S设计引物，但是生工说不能设计，只能看文献了...

可以的，你自己要提交序列啊，生工肯定不会给你设计序列的，他们只会合成！

将你的这个材料所有的物种的16S选择出来，然后选一些近源的物种的16S,比对一下，挑合适的进行设计就可以了
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致良知
4楼2014-04-23 16:10:43
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