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fzhrobin木虫 (正式写手)
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[交流]
关于土壤生物多样性检测的问题 已有5人参与
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想看下不同处理土壤中的微生物群落的多样性变化，现在都有哪些技术可用的？除了DGGE和高通量测序。 以前做过DGGE,但现在有人说过时了，不知道现在行情怎么样？ 也不知道DGGE的文章能发表在什么水平的杂志上？ 还有，高通量测序似乎很贵，是不是这个就可以发档次比较高的文章呢？ |
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quiller2000
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木虫/panda: 金币+10, 感谢虫友交流，说的非常好 2014-04-24 21:20:19
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木虫/panda: 金币+10, 感谢虫友交流，说的非常好 2014-04-24 21:20:19
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能不能发高水平的文章与实验设计和发现有关系，技术只是一个手段而已。 具体而言，DGGE和NGS都是评价遗传多样性，但是限于价格，不可能大量的做NGS除非自己有设备和试剂，而DGGE的分辨率低，一般一个泳道也就几十条带，但是在大量样品的平行比较中，可以挑选出差异的条带进行分析，可以在遗传多样性上做动态的评价和分析，也就是做群落动力学。 PLFA和BIOLOG ECO都可以算是代谢多样性，PLFA可以鉴定到大的种类，如细菌，真菌等等，优点是价格便宜，分辨率高，缺点是无法鉴定到种属，只能评价宏观变化。BIOLOG ECO是碳源利用多样性，这个在土壤微生物分析中意义其实很有限。 除此之外，遗传多样性上还有克隆文库，RFLP，FISH等等，差点儿忘记了，还有一个我个人觉得挺好的ARISA技术，价格便宜，分辨率高。 发文章和你采用的技术有关系，但是没有必然关系。关键是要有好的科学或者运用的价值，有核心的科学或者工程意义！ |
fzhrobin
5楼2014-04-24 17:33:14
nanjizhou91
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fzhrobin
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