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关于土壤生物多样性检测的问题
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fzhrobin
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[交流]
关于土壤生物多样性检测的问题
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想看下不同处理土壤中的微生物群落的多样性变化,现在都有哪些技术可用的?除了DGGE和高通量测序。
以前做过DGGE,但现在有人说过时了,不知道现在行情怎么样?
也不知道DGGE的文章能发表在什么水平的杂志上?
还有,高通量测序似乎很贵,是不是这个就可以发档次比较高的文章呢?
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1楼
2014-04-22 15:13:49
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fzhrobin
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5楼
:
Originally posted by
quiller2000
at 2014-04-24 17:33:14
能不能发高水平的文章与实验设计和发现有关系,技术只是一个手段而已。
具体而言,DGGE和NGS都是评价遗传多样性,但是限于价格,不可能大量的做NGS除非自己有设备和试剂,而DGGE的分辨率低,一般一个泳道也就几十条 ...
请问ARISA哪个公司可以做?费用多少?
如果想做土壤中微生物菌群多样性变化,用ARISA好还是DGGE更好?那个目前更流行?公认性更强?主要是发文章方面
谢谢
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10楼
2014-04-29 09:08:31
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nanjizhou91
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楼主做的DGGE能鉴定到细菌的种吗?另外,听一位师兄说,高通量只能鉴定到属,我也要做DGGE,来交流交流
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期望与虫虫们交流学术问题
2楼
2014-04-22 18:36:14
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fzhrobin
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DGGE需要跑完胶切胶回收的,然后克隆测序,得到的片段只有两三百bp,想用这个鉴定到种,难
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3楼
2014-04-23 10:15:49
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J_iee
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2014-04-24 21:18:54
还有PLFA,就一个色谱然后鉴定,年代也久,但也可以发高水平文章。做了高通量还要看你怎么分析结果,才能发好点的文章。至于DGGE,个人觉得也挺好的,就是条件摸索起来麻烦点
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4楼
2014-04-24 11:22:32
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