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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 农林综合 » 关于土壤生物多样性检测的问题
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fzhrobin

木虫 (正式写手)

[交流] 关于土壤生物多样性检测的问题 已有5人参与

想看下不同处理土壤中的微生物群落的多样性变化，现在都有哪些技术可用的？除了DGGE和高通量测序。
以前做过DGGE,但现在有人说过时了，不知道现在行情怎么样？
也不知道DGGE的文章能发表在什么水平的杂志上？
还有，高通量测序似乎很贵，是不是这个就可以发档次比较高的文章呢？
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1楼 2014-04-22 15:13:49
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fzhrobin

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by quiller2000 at 2014-04-24 17:33:14
能不能发高水平的文章与实验设计和发现有关系，技术只是一个手段而已。
具体而言，DGGE和NGS都是评价遗传多样性，但是限于价格，不可能大量的做NGS除非自己有设备和试剂，而DGGE的分辨率低，一般一个泳道也就几十条 ...

请问ARISA哪个公司可以做？费用多少？
如果想做土壤中微生物菌群多样性变化，用ARISA好还是DGGE更好？那个目前更流行？公认性更强？主要是发文章方面

谢谢
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10楼2014-04-29 09:08:31
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nanjizhou91

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主做的DGGE能鉴定到细菌的种吗？另外，听一位师兄说，高通量只能鉴定到属，我也要做DGGE，来交流交流
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期望与虫虫们交流学术问题
2楼2014-04-22 18:36:14
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fzhrobin

木虫 (正式写手)
DGGE需要跑完胶切胶回收的，然后克隆测序，得到的片段只有两三百bp，想用这个鉴定到种，难
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3楼2014-04-23 10:15:49
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J_iee

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
木虫/panda: 金币+2, 感谢交流，欢迎常来农林版~ 2014-04-24 21:18:54
还有PLFA，就一个色谱然后鉴定，年代也久，但也可以发高水平文章。做了高通量还要看你怎么分析结果，才能发好点的文章。至于DGGE，个人觉得也挺好的，就是条件摸索起来麻烦点
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4楼2014-04-24 11:22:32
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