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构型优化失败 已有1人参与
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为什么我用buildlayer功能构造完模型后，跑构型优化失败呢，请高人指点，下面是我的输出文件和模型图 Forcite ------- Task : Geometry Optimization Version : 6.0 Build date : Dec 8 2011 Host : WIN-V0FJFGH9EFN Threads : Parallel 10 Operating system : Windows Task started : Thu Mar 27 14:38:02 2014 ---- Geometry optimization parameters ---- Algorithm : Smart Convergence tolerance: Energy : 0.0001 kcal/mol Force : 0.005 kcal/mol/A Stress : 0.005 GPa Displacement : 5e-005 A Maximum number of iterations : 1000 External pressure : 0 GPa Motion groups rigid : YES Optimize cell : NO ---- Energy parameters ---- Forcefield : COMPASS Electrostatic terms: Summation method : Ewald Accuracy : 1e-005 kcal/mol Buffer width : 0.5 A van der Waals terms: Summation method : Atom based Truncation method : Cubic spline Cutoff distance : 18.5 A Spline width : 1 A Buffer width : 0.5 A Energy Server failed. The typing engine has failed to calculate a forcefield type for 2 particles. Try using a different forcefield or assign types manually (and remember to turn off the automatic calculation of forcefield types). Unable to calculate energy and gradients. Geometry optimization finished with an error condition. Task terminated : Thu Mar 27 14:38:03 2014 Total CPU time used by Forcite: 1 seconds (1.06s) Termination status : Error  1.png |
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6楼2014-04-01 09:15:14
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The typing engine has failed to calculate a forcefield type for 2 particles. 模型里有部分原子没有分配力场 重新打开模型文件，forcite——energy tab——forcefield旁的more——取消calculate auto——点calculate——错误提示后点yes，软件会标记出没分配力场的原子【看看是不是有缺H什么的情况】 貌似体系主要是CHO，compass不行的话试试universal、dreiding和pcff [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
2楼2014-03-27 14:56:19
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pigrass
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4楼2014-03-27 20:22:42
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