应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp优化构型出现了键的断裂
121/1返回列表
查看: 2999  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

刘小伟110

木虫 (小有名气)

[交流] vasp优化构型出现了键的断裂

作为一个小虫，还请麻烦各位大虫一下。。。如果能对我有帮助，金币会尽最大努力给的。。。我把MS中的模型，用VESTA导入到vasp中，但是在vasp优化时，达到reach，但是本来连着的键断裂啦。。。。不知原因，求解，在此谢谢各位大虫啦。。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2013-11-25 19:52:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-11-26 01:15:28
刘小伟110: 金币+1 2013-11-26 10:41:09
??N???? "??????" ???
1) ??VESTA?????г??F?I????~??????I???
2) ??????w??????????x??????^??????h

?@?????????????
赞一下 回复此楼
2楼2013-11-25 23:04:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-11-26 01:15:47
刘小伟110: 金币+1 2013-11-26 10:41:19
???????:
2?: Originally posted by jpchou at 2013-11-25 23:04:13
??N???? "??????" ???
1) ??VESTA?????г??F?I????~??????I???
2) ??????w??????????x??????^??????h

?@?????????????

????????????????????????????
赞一下 回复此楼
3楼2013-11-25 23:15:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)
???????:
2?: Originally posted by jpchou at 2013-11-25 23:04:13
??N???? "??????" ???
1) ??VESTA?????г??F?I????~??????I???
2) ??????w??????????x??????^??????h

?@?????????????

jpchou????????????????VESTA?????????????????????????ú?????????vasp???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????chem3D????vasp??????????????
赞一下 回复此楼
4楼2013-11-26 10:40:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2013-11-25 23:15:01
个人从楼主的描述猜测，应该是第一个。...

顾问啊，您别猜测啊，来救我吧。。。。
赞一下 回复此楼
5楼2013-11-26 10:40:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
???????:
4?: Originally posted by ??С?110 at 2013-11-26 10:40:12
jpchou????????????????VESTA?????????????????????????ú?????????vasp???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ...

????????? visualization software (vesta??chem3D?? ???)
??????????
??X?ж???????g???x????????F bond
?@?ǹ???? (??Щ??w?????)

??? chem3D ?A?O????????x 2.0 ????F?I?Y
????????????w?????x??? 2.001
???????????I?Y??
????~~ ?????????????????x???????L??
(?????????????L??????]??v??~??????w???e)
赞一下 回复此楼
6楼2013-11-26 16:38:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)
???????:
6?: Originally posted by jpchou at 2013-11-26 16:38:30
????????? visualization software (vesta??chem3D?? ???)
??????????
??X?ж???????g???x????????F bond
?@?ǹ???? (??Щ??w?????)

??? chem3D ?A?O????????x 2.0 ????F?I?Y
?????????? ...

????????????????1.9??????????2.1??????chem3D??????????????MS?п????????????????????????chem3D?л????????????????????????????????????????????????????????????vasp?????INCAR ????????????
赞一下 回复此楼
7楼2013-11-26 20:17:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
???????:
7?: Originally posted by ??С?110 at 2013-11-26 20:17:47
????????????????1.9??????????2.1??????chem3D??????????????MS?п????????????????????????chem3D?л????????????????????????????????????????????????????????????vasp?????INCAR ?? ...

=_= ~
????????}??????~
???}??? chem3D ????I???ж???e???
????N????????????????}?? (INCAR) .....
?и??????}???????
POTCAR ?????m
K ?c?o?????~ ?T???????
赞一下 回复此楼
8楼2013-11-26 20:25:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖！ 2013-11-27 16:49:46
引用回帖:
7楼: Originally posted by 刘小伟110 at 2013-11-26 20:17:47
键的距离变长了，原来是1.9埃，现在是2.1埃，在chem3D中是断键啦，但在MS中看却没断键。。。但是我一直会在chem3D中画图啊，这样的话以后算吸附岂不是看不到成键不成键呢。。。。可不可能是我的vasp设置的INCAR 有 ...

你需要调整一下你的Chem3D的参数，设定一个合适的键长上限，让它把该画上键的原子之间给画上键。MS和Chem3D的画图参数不同导致画出来不同，但这对你的数据没有影响。
赞一下 回复此楼
9楼2013-11-27 00:26:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)
???????:
8?: Originally posted by jpchou at 2013-11-26 20:25:51
=_= ~
????????}??????~
???}??? chem3D ????I???ж???e???
????N????????????????}?? (INCAR) .....
?и??????}???????
POTCAR ?????m
K ?c?o?????~ ?T???????...

jpchou????????????????????????????????chem3D???????????????????????????????????????????????????chem3D??????????????ü??????????????????????????POSCAR?????????ms??????????????????????????????????????????????????
赞一下 回复此楼
10楼2013-11-27 15:50:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘小伟110

木虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by KalaShayminS at 2013-11-27 00:26:11
你需要调整一下你的Chem3D的参数，设定一个合适的键长上限，让它把该画上键的原子之间给画上键。MS和Chem3D的画图参数不同导致画出来不同，但这对你的数据没有影响。...

我以后要用chem3D画图的，如果吸附的分子，本来成键，现在不能成键，会很影响视觉的，chem3D也没见到有人会设置键长，现在都愁死啦。。。还有一种感觉就是，感觉在MS中什么长度都能成键的感觉。。
赞一下 回复此楼
11楼2013-11-27 15:52:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
???....

???d chem3D ???
ex:  http://www.camsoft.co.kr/service ... hem3d_8_english.pdf
????
??????????С??

???? 56 ?
Creating Bonds by Bond
Proximate Addition
?@??ξ?????????
赞一下 回复此楼
12楼2013-11-27 16:42:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 刘小伟110 的主题更新
121/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 Ma_xt 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4 一志愿京区211 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 一志愿华中农业071010，总分320求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:38 by 学员8dgXkO
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿福大288有机化学，求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 化学工程321分求调剂 +15 大米饭！ 2026-03-15 18/900 2026-03-18 14:52 by haxia
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 268求调剂 +8 一定有学上- 2026-03-14 9/450 2026-03-17 17:47 by laoshidan
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭