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刘小伟110

木虫 (小有名气)


[交流] vasp优化构型出现了键的断裂

作为一个小虫,还请麻烦各位大虫一下。。。如果能对我有帮助,金币会尽最大努力给的。。。我把MS中的模型,用VESTA导入到vasp中,但是在vasp优化时,达到reach,但是本来连着的键断裂啦。。。。不知原因,求解,在此谢谢各位大虫啦。。。
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-11-26 01:15:28
刘小伟110: 金币+1 2013-11-26 10:41:09
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1) ??VESTA?????г??F?I????~??????I???
2) ??????w??????????x??????^??????h

?@?????????????
2楼2013-11-25 23:04:13
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-11-26 01:15:47
刘小伟110: 金币+1 2013-11-26 10:41:19
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2?: Originally posted by jpchou at 2013-11-25 23:04:13
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3楼2013-11-25 23:15:01
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刘小伟110

木虫 (小有名气)


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2?: Originally posted by jpchou at 2013-11-25 23:04:13
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1) ??VESTA?????г??F?I????~??????I???
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4楼2013-11-26 10:40:12
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刘小伟110

木虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2013-11-25 23:15:01
个人从楼主的描述猜测,应该是第一个。...

顾问啊,您别猜测啊,来救我吧。。。。
5楼2013-11-26 10:40:52
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???????:
4?: Originally posted by ??С?110 at 2013-11-26 10:40:12
jpchou????????????????VESTA?????????????????????????ú?????????vasp???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ...

????????? visualization software (vesta??chem3D?? ???)
??????????
??X?ж???????g???x????????F bond
?@?ǹ???? (??Щ??w?????)

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6楼2013-11-26 16:38:30
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刘小伟110

木虫 (小有名气)


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6?: Originally posted by jpchou at 2013-11-26 16:38:30
????????? visualization software (vesta??chem3D?? ???)
??????????
??X?ж???????g???x????????F bond
?@?ǹ???? (??Щ??w?????)

??? chem3D ?A?O????????x 2.0 ????F?I?Y
?????????? ...

????????????????1.9??????????2.1??????chem3D??????????????MS?п????????????????????????chem3D?л????????????????????????????????????????????????????????????vasp?????INCAR ????????????
7楼2013-11-26 20:17:47
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???????:
7?: Originally posted by ??С?110 at 2013-11-26 20:17:47
????????????????1.9??????????2.1??????chem3D??????????????MS?п????????????????????????chem3D?л????????????????????????????????????????????????????????????vasp?????INCAR ?? ...

=_= ~
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???}??? chem3D ????I???ж???e???
????N????????????????}?? (INCAR) .....
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POTCAR ?????m
K ?c?o?????~ ?T???????
8楼2013-11-26 20:25:51
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)


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fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖! 2013-11-27 16:49:46
引用回帖:
7楼: Originally posted by 刘小伟110 at 2013-11-26 20:17:47
键的距离变长了,原来是1.9埃,现在是2.1埃,在chem3D中是断键啦,但在MS中看却没断键。。。但是我一直会在chem3D中画图啊,这样的话以后算吸附岂不是看不到成键不成键呢。。。。可不可能是我的vasp设置的INCAR 有 ...

你需要调整一下你的Chem3D的参数,设定一个合适的键长上限,让它把该画上键的原子之间给画上键。MS和Chem3D的画图参数不同导致画出来不同,但这对你的数据没有影响。
9楼2013-11-27 00:26:11
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刘小伟110

木虫 (小有名气)


???????:
8?: Originally posted by jpchou at 2013-11-26 20:25:51
=_= ~
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???}??? chem3D ????I???ж???e???
????N????????????????}?? (INCAR) .....
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K ?c?o?????~ ?T???????...

jpchou????????????????????????????????chem3D???????????????????????????????????????????????????chem3D??????????????ü??????????????????????????POSCAR?????????ms??????????????????????????????????????????????????
10楼2013-11-27 15:50:15
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刘小伟110

木虫 (小有名气)


引用回帖:
9楼: Originally posted by KalaShayminS at 2013-11-27 00:26:11
你需要调整一下你的Chem3D的参数,设定一个合适的键长上限,让它把该画上键的原子之间给画上键。MS和Chem3D的画图参数不同导致画出来不同,但这对你的数据没有影响。...

我以后要用chem3D画图的,如果吸附的分子,本来成键,现在不能成键,会很影响视觉的,chem3D也没见到有人会设置键长,现在都愁死啦。。。还有一种感觉就是,感觉在MS中什么长度都能成键的感觉。。
11楼2013-11-27 15:52:19
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
???....

???d chem3D ???
ex:  http://www.camsoft.co.kr/service ... hem3d_8_english.pdf
????
??????????С??

???? 56 ?
Creating Bonds by Bond
Proximate Addition
?@??ξ?????????
12楼2013-11-27 16:42:04
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