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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助 关于把蛋白质的编码序列翻译成氨基酸序列的问题
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lavender2056

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助 关于把蛋白质的编码序列翻译成氨基酸序列的问题 已有2人参与

新人一枚  是老师布置的理论作业  给了一段链霉菌蛋白质的部分编码序列  要求转成氨基酸序列
我想问的是 （1）氨基酸一定是从这条已知的编码序列中翻译的嘛  有没有可能从这条编码序列的互补链翻译？
                  （2）所谓编码序列里面 会不会存在非编码区？
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1楼 2014-03-16 12:04:29
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by lavender2056 at 2014-03-16 15:12:35
老师给出的是部分的编码序列 编码序列应该是没有启动子和终止子的吧？...

这个简单啊，把序列在NCBI上BLAST一下，找到全长cDNA序列就好了啊，再看看老师给的序列式全长cDNA序列中的那一段。
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没有做不到，只有想不到！
7楼2014-03-17 14:00:48
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lihe131

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-16 14:36:45
lavender2056: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-03-18 19:27:35
且不谈作业的要求，
1.在酵母中，研究表明互补的两条DNA链有可能都是翻译的模板，但是在链霉菌中不清楚。
2.既然是叫编码序列，当然没有非编码区。
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2楼2014-03-16 12:13:36
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-16 14:36:16
lavender2056: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-03-18 19:27:41
对于这个问题，给你几个建议：
第一，找到起始密码子（ATG）和终止密码子（TAA，TAG。TGA）如果没法一眼看出来，就用软件查找，推荐NCBI上的ORF finder
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
这样就不用考虑哪条链是编码链啦；
第二，链霉菌属于细菌界，也就是属于原核生物，所以不存在真核生物那样的内含子序列，至于5‘ UTR和3’ TUR在找到起始密码子和终止密码子后也就解决了。
以上鄙人拙见，仅供参考
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没有做不到，只有想不到！
3楼2014-03-16 13:11:46
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lavender2056

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 王平阳 at 2014-03-16 13:11:46
对于这个问题，给你几个建议：
第一，找到起始密码子（ATG）和终止密码子（TAA，TAG。TGA）如果没法一眼看出来，就用软件查找，推荐NCBI上的ORF finder
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
这样就不用考 ...

老师给出的是部分的编码序列 编码序列应该是没有启动子和终止子的吧？
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4楼2014-03-16 15:12:35
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