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胡海静

铜虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质翻译成核苷酸

如果只知道蛋白质的序列，想得到他的核苷酸序列怎么办啊？因为密码子的兼并性直接翻译似乎不可能啊，难道需要测它的两端氨基酸序列码？求大神们指导啊
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1楼 2013-07-15 15:31:59
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
知道了蛋白质的序列就是知道了氨基酸的序列了。蛋白质就是由氨基酸构成的。那通过氨基酸序列直接翻译成核苷酸序列了。
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2楼2013-07-17 17:04:30
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胡海静

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-17 17:04:30
知道了蛋白质的序列就是知道了氨基酸的序列了。蛋白质就是由氨基酸构成的。那通过氨基酸序列直接翻译成核苷酸序列了。

同一个氨基酸可以由好几种密码子的呀，那样由氨基酸直接翻译成核苷酸是不是有很多种组合？获得的核苷酸序列并不唯一啊
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3楼2013-07-18 09:27:26
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huanghznd

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
胡海静: 金币+5, ★有帮助 2013-07-18 15:13:24
引用回帖:
3楼: Originally posted by 胡海静 at 2013-07-18 09:27:26
同一个氨基酸可以由好几种密码子的呀，那样由氨基酸直接翻译成核苷酸是不是有很多种组合？获得的核苷酸序列并不唯一啊...

是的，不同的菌都有自己的一套偏好密码子。有些菌的密码子偏好表，网上都有，就看你怎么用了。
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4楼2013-07-18 09:46:31
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胡海静

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-18 09:46:31
是的，不同的菌都有自己的一套偏好密码子。有些菌的密码子偏好表，网上都有，就看你怎么用了。...

谢谢，可是我上网查了，没有查到偏好表啊，我需要枯草芽孢杆菌的，求帮助
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5楼2013-07-18 15:14:27
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huanghznd

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 胡海静 at 2013-07-18 15:14:27
谢谢，可是我上网查了，没有查到偏好表啊，我需要枯草芽孢杆菌的，求帮助...

我也没有找到，但有一个类似的，希望对你有帮助

Bacillus sp. LU11 [gbbct]: 3 CDS's (1617 codons)
--------------------------------------------------------------------------------
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 35.3(    57)  UCU 15.5(    25)  UAU 26.6(    43)  UGU  8.7(    14)
UUC  7.4(    12)  UCC  5.6(     9)  UAC  4.9(     8)  UGC  0.6(     1)
UUA 56.3(    91)  UCA 16.7(    27)  UAA  0.6(     1)  UGA  1.2(     2)
UUG 21.0(    34)  UCG  4.9(     8)  UAG  0.0(     0)  UGG 12.4(    20)

CUU 16.7(    27)  CCU 19.8(    32)  CAU  7.4(    12)  CGU  5.6(     9)
CUC  3.7(     6)  CCC  1.2(     2)  CAC  3.7(     6)  CGC  0.6(     1)
CUA  8.7(    14)  CCA 17.3(    28)  CAA 19.2(    31)  CGA  4.9(     8)
CUG  2.5(     4)  CCG  6.8(    11)  CAG  7.4(    12)  CGG  1.2(     2)

AUU 36.5(    59)  ACU 19.2(    31)  AAU 62.5(   101)  AGU 21.6(    35)
AUC  8.7(    14)  ACC  2.5(     4)  AAC 11.1(    18)  AGC  3.7(     6)
AUA 47.0(    76)  ACA 23.5(    38)  AAA 63.7(   103)  AGA 25.4(    41)
AUG 13.0(    21)  ACG  2.5(     4)  AAG 26.0(    42)  AGG  8.0(    13)

GUU 31.5(    51)  GCU  8.7(    14)  GAU 42.7(    69)  GGU 16.7(    27)
GUC  2.5(     4)  GCC  5.6(     9)  GAC  8.0(    13)  GGC  4.9(     8)
GUA 24.7(    40)  GCA 19.8(    32)  GAA 50.7(    82)  GGA 24.1(    39)
GUG  6.2(    10)  GCG  3.7(     6)  GAG 22.9(    37)  GGG  8.0(    13)
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

胡海静
6楼2013-07-18 16:18:08
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胡海静

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by huanghznd at 2013-07-18 16:18:08
我也没有找到，但有一个类似的，希望对你有帮助

Bacillus sp. LU11 : 3 CDS's (1617 codons)
--------------------------------------------------------------------------------
fields:   ()
UUU 35.3( ...

谢啦！！
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7楼2013-07-18 16:44:17
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