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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 有没有做amoA基因的，求交流啊！
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haocuihua

新虫 (初入文坛)

[求助] 有没有做amoA基因的，求交流啊！已有3人参与

大家好，我在做氨氧化细菌，在过程中难免遇到一些问题，希望可以认识一些朋友，共同交流！
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三年结束后还是个女人
1楼2014-03-10 19:16:28
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我们实验室原来做氨氧化古菌，现在不做了，你可以搜搜文献么，川农、中国地大做氨氧化的团队都比较成熟的~~
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2楼2014-03-10 22:54:35
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leemeng

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dllchina: 金币+1, 鼓励应助 2014-03-11 14:16:36
haocuihua: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢！ 2014-03-11 21:56:02
不知道你想问哪方面的内容，之前有做过一些。
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3楼2014-03-11 06:27:32
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haocuihua

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-10 22:54:35
我们实验室原来做氨氧化古菌，现在不做了，你可以搜搜文献么，川农、中国地大做氨氧化的团队都比较成熟的~~

文献搜过了，现在是出现了非常奇怪的问题，同时提了三个总DNA，现在两个可以P出来，一个怎么也不行。检测了DNA是有的，觉得奇怪啊！
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三年结束后还是个女人
4楼2014-03-11 14:14:16
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haocuihua

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by leemeng at 2014-03-11 06:27:32
不知道你想问哪方面的内容，之前有做过一些。

我提的土壤总DNA，三个样品总DNA都是有的，现在两个样品可以P出来，一个P不出来，找不到原因
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三年结束后还是个女人
5楼2014-03-11 14:15:44
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leemeng

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
dllchina: 金币+3, 鼓励热心应助 2014-03-12 01:03:29
引用回帖:
5楼: Originally posted by haocuihua at 2014-03-11 14:15:44
我提的土壤总DNA，三个样品总DNA都是有的，现在两个样品可以P出来，一个P不出来，找不到原因...

导致这个问题原因可能有很多，我感觉还是主要从样品DNA纯度考虑吧。 1.该土壤样品理化性质是否明确区别于其他样品？得到的DNA纯度如何？土壤腐殖酸较多，容易影响pcr效率。2. 这个样品自身的amoA基因丰度是否可能比较少？。。。
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6楼2014-03-11 21:49:23
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haocuihua

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by leemeng at 2014-03-11 21:49:23
导致这个问题原因可能有很多，我感觉还是主要从样品DNA纯度考虑吧。 1.该土壤样品理化性质是否明确区别于其他样品？得到的DNA纯度如何？土壤腐殖酸较多，容易影响pcr效率。2. 这个样品自身的amoA基因丰度是否可能比 ...

理化性质上相差不大，用试剂盒提取的纯度应该是有保障的，目前不知道丰度如何！还有，你知不知道怎么样算是一个文库啊？
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三年结束后还是个女人
7楼2014-03-11 21:55:13
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一纸淡然

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

可能腐植酸的影响，用FastDNA Spin Kit for soil比较好，提的DNA比较干净~~~
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8楼2014-05-22 09:13:48
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zengxianlei

铁虫 (初入文坛)
我才做氨氧化细菌多样性的研究，不知道什么方法是最好的。为什么不做16SrDNA，或是hzo基因，要做amoA了？求指教
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9楼2014-05-22 09:45:03
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