| 查看: 1787 | 回复: 5 | ||
[求助]
关于gromacs续跑连接文件的问题已有4人参与
|
|
请教:gromacs MD开始先跑了50ns,然后用tpbconv命令又续跑了50ns,跑到了100ns,现在有两个trr文件,我把他们分别转化成了pdb合适的,现在想把两个pdb连在一起,用户trjcat命令,命令如下:trjcat -f a.pdb b.pdb -o new.pdb ,但是提示错误,错误为“Fatal error: Can not write a pdb file without atom names 怎么回事呢?没办法这样连接? 我只是想得到全部100ns的pdb文件,整个的,还有更好的办法吗? 虚心求教!!感谢!! |
» 猜你喜欢
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有5人回复
Bioresource Technology期刊,第一次返修的时候被退回好几次了
已经有7人回复
真诚求助:手里的省社科项目结项要求主持人一篇中文核心,有什么渠道能发核心吗
已经有8人回复
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有5人回复
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有4人回复
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有14人回复
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
请问有评职称,把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有5人回复
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有4人回复
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容,为什么?
已经有4人回复
离子液体模拟:如何从别的软件移植力场到Gromacs(itp文件的含义以及如何写itp文件)
已经有4人回复
gromacs无法生成gro文件
已经有5人回复
gromacs,用pdb文件生成top文件时遇到的问题
已经有4人回复
如何用MS的纳米管坐标转到gromacs可识别的文件
已经有7人回复
GROMACS 小分子top文件
已经有9人回复
【求助】重金求助:gromacs中g_rms命令中怎样应用index.ndx文件
已经有8人回复
【求助】求助Gromacs中关于g_hbond的out文件的问题
已经有10人回复
fangsteel
木虫 (正式写手)
- 应助: 96 (初中生)
- 金币: 1211.6
- 散金: 32
- 红花: 22
- 帖子: 456
- 在线: 192.1小时
- 虫号: 2248690
- 注册: 2013-01-18
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理

2楼2014-03-10 17:20:05
lisuperyao
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 21872.7
- 散金: 2500
- 红花: 4
- 帖子: 2971
- 在线: 273小时
- 虫号: 1210362
- 注册: 2011-02-23
- 专业: 化学反应工程
3楼2014-03-11 16:12:50
4楼2014-03-11 17:08:42
5楼2014-03-16 17:50:11
6楼2014-03-17 09:58:19













回复此楼