| 查看: 1834 | 回复: 5 | ||
[求助]
关于gromacs续跑连接文件的问题 已有4人参与
|
|
请教：gromacs MD开始先跑了50ns，然后用tpbconv命令又续跑了50ns，跑到了100ns，现在有两个trr文件，我把他们分别转化成了pdb合适的，现在想把两个pdb连在一起，用户trjcat命令，命令如下：trjcat -f a.pdb b.pdb -o new.pdb ,但是提示错误，错误为“Fatal error: Can not write a pdb file without atom names 怎么回事呢？没办法这样连接？ 我只是想得到全部100ns的pdb文件，整个的，还有更好的办法吗？ 虚心求教！！感谢！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
垃圾破二本职称评审标准
已经有19人回复
-
职称评审没过，求安慰
已经有53人回复
-
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有5人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容，为什么？
已经有4人回复
- 离子液体模拟：如何从别的软件移植力场到Gromacs（itp文件的含义以及如何写itp文件）
已经有4人回复
- gromacs无法生成gro文件
已经有5人回复
- gromacs，用pdb文件生成top文件时遇到的问题
已经有4人回复
- 如何用MS的纳米管坐标转到gromacs可识别的文件
已经有7人回复
- GROMACS 小分子top文件
已经有9人回复
- 【求助】重金求助：gromacs中g_rms命令中怎样应用index.ndx文件
已经有8人回复
- 【求助】求助Gromacs中关于g_hbond的out文件的问题
已经有10人回复
fangsteel
木虫 (正式写手)
- 应助: 96 (初中生)
- 金币: 1211.6
- 散金: 32
- 红花: 22
- 帖子: 456
- 在线: 192.1小时
- 虫号: 2248690
- 注册: 2013-01-18
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
2楼2014-03-10 17:20:05
lisuperyao
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 21979.7
- 散金: 2500
- 红花: 4
- 帖子: 2988
- 在线: 273.3小时
- 虫号: 1210362
- 注册: 2011-02-23
- 专业: 化学反应工程
3楼2014-03-11 16:12:50
4楼2014-03-11 17:08:42
5楼2014-03-16 17:50:11
6楼2014-03-17 09:58:19