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moye1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于gromacs续跑连接文件的问题 已有4人参与

请教:gromacs MD开始先跑了50ns,然后用tpbconv命令又续跑了50ns,跑到了100ns,现在有两个trr文件,我把他们分别转化成了pdb合适的,现在想把两个pdb连在一起,用户trjcat命令,命令如下:trjcat -f a.pdb b.pdb -o new.pdb ,但是提示错误,错误为“Fatal error:
Can not write a pdb file without atom names
怎么回事呢?没办法这样连接?
我只是想得到全部100ns的pdb文件,整个的,还有更好的办法吗?
虚心求教!!感谢!!
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-10 19:21:07
moye1991: 金币+1, 呃,解决好了呢 2014-03-17 09:57:47
有意思额,在trjcat命令里没有能输出pdb文件的选项。能把你的trr文件拿过来看看不
2209687362
gromacs
2楼2014-03-10 17:20:05
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