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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 急！!!!!同一测序材料中miRNA和转录组两者之间的数据是如何分析的？
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清新百合3

金虫 (正式写手)

[求助] 急！!!!!同一测序材料中miRNA和转录组两者之间的数据是如何分析的？ 已有1人参与

我们现在已经得到某种植物某一组织的miRNA和转录组的测序数据，但是不知道把这两组数据结合起来怎么分析。
也就是从miRNA数据到转录组数据这两组数据结合起来分析的具体过程是怎样的？
求做过类似研究的高手虫友指点，谢谢了。

[ Last edited by 清新百合3 on 2014-3-7 at 17:59 ]
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心如止水
1楼 2014-03-08 00:55:20
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戴胜鸟的爱

新虫 (初入文坛)
同求
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2楼2014-04-05 09:56:18
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growlywolf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

由于小RNA测序和普通RNA-Seq建库的原理，miRNA前体往往不会在普通RNA-Seq的结果中反映出来，因此你无法用小RNA测序和RNA-Seq的结果来预测miRNA基因，但可以用来预测miRNA的靶基因。然后可以分析这些靶基因的表达差异，进而推测miRNA的功能。

当然，如果你有降解组测序的结果，miRNA靶基因的分析就更准确了。
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3楼2014-04-22 10:51:39
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