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基因组可视化软件,查看基因在整个基因组中的位置
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tzaixmc
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虫号: 977490
注册: 2010-03-21
专业: 病原细菌与放线菌生物学
[
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]
基因组可视化软件,查看基因在整个基因组中的位置
我现在测了一个细菌的基因组,最后有10个scafflod左右,基因组大小在4M左右,glimmer对基因进行了预测,现在有scafflod的序列fasta文件,glimmer预测的的基因序列文件,我想查看基因在整个scafflod中的相对位置包括正反向,上下游序列等,有什么软件有这些功能啊,试了几个如GenomeView,Artemis等,但是好像只能查看整个scafflod的序列并把所有可能的翻译氨基酸都列出来。请高手指点一下,哪些软件能满足我的要求。谢谢!
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2014-02-09 17:14:53
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