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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » GROMACS运行完后的结果分析
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_蝶飞

铜虫 (小有名气)

[求助] GROMACS运行完后的结果分析

各位大神，小人科研菜鸟一枚，目前的研究方向为蛋白质的水合层研究，蛋白质与周围的水分子有一定的耦合作用，目前用GROMACS正在运行，想根据偶极距做自相关函数模拟相关光谱，但是怎么从GROMACS里得到偶极距的数据呢？请各位指教！谢谢。。。！
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1楼 2014-01-12 16:26:08
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-13 22:41:57
_蝶飞: 金币+5 2014-01-14 12:00:48
本帖内容被屏蔽
2楼2014-01-13 11:48:25
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_蝶飞

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-01-13 11:48:25
偶极距可能不行 mm计算不知道会不会精确到电子层面

那通过分子动力学的方法，有哪些途径能得到偶极矩的数据吖，mm算法我不懂呢，GROMACS的结果分析能起到什么作用？。。。多谢了~~
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3楼2014-01-13 13:34:11
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smutao

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
4楼2014-01-14 12:09:06
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jikoukou

铁虫 (初入文坛)
问题解决了吗
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啦啦啦~
5楼2015-11-26 14:54:14
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