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gromacs运行出错
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我想请教你一个问题：我使用gromacs，选择力场之后它出现这样的错误： Reading 1omb.pdb... ------------------------------------------------------- Program pdb2gmx, VERSION 3.3.1 Source code file: futil.c, line: 340 File input/output error: 1omb.pdb ------------------------------------------------------- 请问这是怎么回事？ 注：我安装gromacs-3.3.1在root下安装的，使用时新建了一个用户xie。进去xie这个用户，在xie这个文件夹下建立一个名为“fwspider”的文件夹。在此文件夹下新建三个子文件夹，分别命名为：“invacuo”“wet”和“ionwet”。然后把1omb.pdb拷进去，使用dos2nnix命令分别转换这三个文件夹下的蛋白质格式。 还有一个问题：请问安装gromacs-4.5.4应该使用fftw-3.1.2还是fftw-3.2.2？lam-7.1.3这个东西是不是必须的呢？ |
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gxsulong
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