| 查看: 1848 | 回复: 3 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
gromacs运行出错
|
||
|
我想请教你一个问题：我使用gromacs，选择力场之后它出现这样的错误： Reading 1omb.pdb... ------------------------------------------------------- Program pdb2gmx, VERSION 3.3.1 Source code file: futil.c, line: 340 File input/output error: 1omb.pdb ------------------------------------------------------- 请问这是怎么回事？ 注：我安装gromacs-3.3.1在root下安装的，使用时新建了一个用户xie。进去xie这个用户，在xie这个文件夹下建立一个名为“fwspider”的文件夹。在此文件夹下新建三个子文件夹，分别命名为：“invacuo”“wet”和“ionwet”。然后把1omb.pdb拷进去，使用dos2nnix命令分别转换这三个文件夹下的蛋白质格式。 还有一个问题：请问安装gromacs-4.5.4应该使用fftw-3.1.2还是fftw-3.2.2？lam-7.1.3这个东西是不是必须的呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
考博求助
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有9人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Gromacs中，mdrun出错
已经有5人回复
- 在gromacs中运行mdrun命令时出错
已经有10人回复
- gromacs 运行pdb2gmx中出错，pdb2gmx: error while loading shared libraries
已经有3人回复
- Gromacs做steep之后做cg出错
已经有5人回复
- gromacs做全原子模拟时候，突然到MD这一步出错
已经有6人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【求助】gromacs的又一个问题
已经有22人回复
- 【求助】Gromacs运行出错
已经有4人回复
- 【求助】gromacs出现了一个问题
已经有10人回复
- 【求助】gromacs出现错误：This usually means your system is exploding
已经有3人回复
4楼2011-05-05 09:12:14
gxsulong
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 20061.3
- 散金: 24
- 红花: 1
- 沙发: 1
- 帖子: 2355
- 在线: 259.3小时
- 虫号: 115084
- 注册: 2005-11-24
- 性别: GG
- 专业: 微生物学
2楼2011-05-04 20:35:28
sichuanemily
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2031.5
- 散金: 18
- 红花: 1
- 帖子: 316
- 在线: 77.5小时
- 虫号: 945131
- 注册: 2010-01-19
- 专业: 临床药理
3楼2011-05-05 08:35:25
