| 查看: 1766 | 回复: 3 | |||
wwm09金虫 (小有名气)
|
[求助]
VASP计算H原子 吸附在Pt(111)表面时，最后CONTCAR 里少了H 原子 已有1人参与
|
RT，请各位帮忙看看这是怎么回事？谢谢 OUTCAR算出的能量与Pt Slab能量相同（因为H原子失踪了）。 CONTCAR 如下 Pt : Pt(111) [3x3, 4 layers] %%（这一行的末尾出现了^M可能是问题的原因，但重新输入后情况不变） 1.000000000000000 8.4946150000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 4.2473080000000000 7.3565330000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 23.1194100000000000 36 Selective dynamics Direct 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.1000000000000014 F F F 0.3333333333333357 0.0000000000000000 0.1000000000000014 F F F 0.6666666666666643 0.0000000000000000 0.1000000000000014 F F F 0.0000000000000000 0.3333333333333357 0.1000000000000014 F F F 0.3333333333333357 0.3333333333333357 0.1000000000000014 F F F 0.6666666666666643 0.3333333333333357 0.1000000000000014 F F F 0.0000000000000000 0.6666666666666643 0.1000000000000014 F F F 0.3333333333333357 0.6666666666666643 0.1000000000000014 F F F 0.6666666666666643 0.6666666666666643 0.1000000000000014 F F F 0.1111111111111143 0.1111111111111143 0.2000000000000028 F F F 0.4444444444444429 0.1111111111111143 0.2000000000000028 F F F 0.7777777777777786 0.1111111111111143 0.2000000000000028 F F F 0.1111111111111143 0.4444444444444429 0.2000000000000028 F F F 0.4444444444444429 0.4444444444444429 0.2000000000000028 F F F 0.7777777777777786 0.4444444444444429 0.2000000000000028 F F F 0.1111111111111143 0.7777777777777786 0.2000000000000028 F F F 0.4444444444444429 0.7777777777777786 0.2000000000000028 F F F 0.7777777777777786 0.7777777777777786 0.2000000000000028 F F F 0.2222213112969953 0.2222221586930037 0.2979456023088535 T T T 0.5555589726304304 0.2222202040481568 0.2979468607458601 T T T 0.8888882657457644 0.2222215254295242 0.2979456008258409 T T T 0.2222215526504422 0.5555568170627582 0.2979464874142188 T T T 0.5555570287112902 0.5555555662755211 0.2979463665621376 T T T 0.8888874742401857 0.5555564182463390 0.2979456572516460 T T T 0.2222209540158847 0.8888898822528157 0.2979462539650056 T T T 0.5555575642905256 0.8888883369427688 0.2979464273376182 T T T 0.8888873025750039 0.8888913435780719 0.2979468240197610 T T T -0.0000005869246331 0.0000001295319143 0.3977266161334645 T T T 0.3333329046084976 -0.0000003446841020 0.3977275955378024 T T T 0.6666677464588719 0.0000004437582833 0.3977272584943250 T T T -0.0000007365677513 0.3333328967949707 0.3977266745040140 T T T 0.3333341801306240 0.3333336301116413 0.3977275688338358 T T T 0.6666671245051308 0.3333326688445418 0.3977267421620061 T T T 0.0000001833473612 0.6666675805750582 0.3977270625181429 T T T 0.3333331400601637 0.6666666154746798 0.3977270419197222 T T T 0.6666667103885983 0.6666660198215224 0.3977274731344342 T T T 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 0.00000000E+00 POSCAR如下： Pt H : H-Pt(111) [3x3, 4 layers] 1.00000000000000 +8.4946150000 +0.0000000000 +0.0000000000 +4.2473080000 +7.3565330000 +0.0000000000 +0.0000000000 +0.0000000000 +23.1194100000 36 1 Selective Cartesian +0.0000000000 +0.0000000000 +2.3119410000 F F F +2.8315383333 +0.0000000000 +2.3119410000 F F F +5.6630766667 +0.0000000000 +2.3119410000 F F F +1.4157693333 +2.4521776667 +2.3119410000 F F F +4.2473076667 +2.4521776667 +2.3119410000 F F F +7.0788460000 +2.4521776667 +2.3119410000 F F F +2.8315386667 +4.9043553333 +2.3119410000 F F F +5.6630770000 +4.9043553333 +2.3119410000 F F F +8.4946153333 +4.9043553333 +2.3119410000 F F F +1.4157692222 +0.8173925556 +4.6238820000 F F F +4.2473075556 +0.8173925556 +4.6238820000 F F F +7.0788458889 +0.8173925556 +4.6238820000 F F F +2.8315385556 +3.2695702222 +4.6238820000 F F F +5.6630768889 +3.2695702222 +4.6238820000 F F F +8.4946152222 +3.2695702222 +4.6238820000 F F F +4.2473078889 +5.7217478889 +4.6238820000 F F F +7.0788462222 +5.7217478889 +4.6238820000 F F F +9.9103845556 +5.7217478889 +4.6238820000 F F F +2.8315384444 +1.6347851111 +6.9358230000 T T T +5.6630767778 +1.6347851111 +6.9358230000 T T T +8.4946151111 +1.6347851111 +6.9358230000 T T T +4.2473077778 +4.0869627778 +6.9358230000 T T T +7.0788461111 +4.0869627778 +6.9358230000 T T T +9.9103844444 +4.0869627778 +6.9358230000 T T T +5.6630771111 +6.5391404444 +6.9358230000 T T T +8.4946154444 +6.5391404444 +6.9358230000 T T T +11.3261537778 +6.5391404444 +6.9358230000 T T T +0.0000000000 +0.0000000000 +9.2477640000 T T T +2.8315383333 +0.0000000000 +9.2477640000 T T T +5.6630766667 +0.0000000000 +9.2477640000 T T T +1.4157693333 +2.4521776667 +9.2477640000 T T T +4.2473076667 +2.4521776667 +9.2477640000 T T T +7.0788460000 +2.4521776667 +9.2477640000 T T T +2.8315386667 +4.9043553333 +9.2477640000 T T T +5.6630770000 +4.9043553333 +9.2477640000 T T T +8.4946153333 +4.9043553333 +9.2477640000 T T T +4.2473080000 +2.4521780000 +10.5597050000 T T T |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 VASP计算 |
» 猜你喜欢
070300化学 求调剂
已经有12人回复
-
化工求调剂！
已经有32人回复
-
291 求调剂
已经有6人回复
-
297求调剂
已经有23人回复
-
283求调剂，工科！
已经有6人回复
-
266求调剂
已经有22人回复
-
287求调剂
已经有18人回复
-
300求调剂
已经有6人回复
-
282，求调剂
已经有3人回复
-
071000生物学调剂求助
已经有8人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp计算磁性的时候 OSICAR中有总磁矩的大小，但是OUTCAR中每个原子的磁矩均显示为0
已经有8人回复
- 为什么我的vesta的export data格式没有.vasp，没办法转换成POSCAR？
已经有12人回复
- vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起
已经有11人回复
- VASP计算表面吸附 但是能量总是不收敛/。。。
已经有9人回复
- VASP-vdW修正问题
已经有24人回复
- vasp结构优化中EDIFF以及KPOINTS设置，以及氢吸附结合能问题！
已经有17人回复
- <求助>VASP 结构优化收敛，静态计算不收敛。（INCAR KPOINTS POSCAR附上）
已经有4人回复
- 画VASP计算的原子结构图的一个方法（自己瞎想的，如和他人方法雷同请见谅）
已经有4人回复
- VASP计算CONTCAR和POSCAR结构一样
已经有19人回复
- vasp计算过程中总得把CONTCAR改成POSCAR再次计算
已经有7人回复
- VASP分子动力学优化的INCAR如下，怎么CONTCAR和POSCAR没有什么变化啊？
已经有13人回复
- vasp优化结构中出现的问题
已经有10人回复
- vasp计算Ag在graphene上的吸附能
已经有7人回复
- 【活动or资源】vasp晶体结构优化
已经有142人回复
- 【任务征集】VASP跑分子动力学数据处理方法
已经有20人回复
- 【求助】VASP计算的KPOINTS 设置，求助
已经有10人回复
- 【求助】用vasp搜寻过渡态的请进
已经有16人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【分享】将VASP中CONTCAR中数据转化成JMOL可读的小程序
已经有4人回复
- 【neweroica个人文集】最新版vaspmo (v0.1) ――可视化VASP分子轨道
已经有103人回复
2楼2014-01-08 10:11:47
wwm09
金虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2335.7
- 红花: 2
- 帖子: 82
- 在线: 107.3小时
- 虫号: 1758408
- 注册: 2012-04-16
- 性别: GG
- 专业: 催化化学
3楼2014-01-08 22:51:14
4楼2014-01-09 08:46:53
100